RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	UBXN2A	P68543	259 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	CCNA1	P78396	465 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	USP17L24	Q0WX57	530 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	MOGS	Q13724	837 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	TREML2	Q5T2D2	321 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	MYPN	Q86TC9	1320 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TTLL3-231	ENST00000496246	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	BCR	P11274	1271 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	CDK8	P49336	464 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP2B2	Q01814	1243 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	NUCB1	Q02818	461 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	ICA1	Q05084	483 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	GABPA	Q06546	454 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	SBK1	Q52WX2	424 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	CTR9	Q6PD62	1173 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	OSBP2	Q969R2	916 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	GOPC	Q9HD26	462 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	SRRD	Q9UH36	339 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	MYH8	P13535	1937 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	RAD21	O60216	631 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	CYP2D6	P10635	497 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	SOX10	P56693	466 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	SEPT2	Q15019	361 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	LPAR1	Q92633	364 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	C12orf42	Q96LP6	360 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	PTPRF	P10586	1907 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	SIPA1L1	O43166	1804 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	HERVK_113	P62684	666 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246		M0R2C6	588 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	TSPY3	P0CV98	308 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	TSPY8	P0CW00	308 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	MAPK4	P31152	587 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	GRK4	P32298	578 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	ARMC5	Q96C12	935 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	IGHD	P01880	384 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	AKR1B1	P15121	316 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	VCAM1	P19320	739 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	WDR78	Q5VTH9	848 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	NEFL	P07196	543 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	CAPN2	P17655	700 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	RGS19	P49795	217 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	PRKCZ	Q05513	592 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	COG2	Q14746	738 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	MB21D1	Q8N884	522 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	ACER1	Q8TDN7	264 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	TOMM22	Q9NS69	142 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	ADCY3	O60266	1144 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	CHGB	P05060	677 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	FLT3LG	P49771	235 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	ERVK-9	P63128	1117 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	ERVK-24	P63145	666 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	JAG1	P78504	1218 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-231	ENST00000496246	PPARA	Q07869	468 aa		13.46	□□□□□ -0.25

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