RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 AKR1B1P15121 316 aa22.77■■□□□ 1.24
NISCH-209ENST00000485765 OSBPP22059 807 aa22.77■■□□□ 1.24
NISCH-209ENST00000485765 CTGFP29279 349 aa22.77■■□□□ 1.24
NISCH-209ENST00000485765 USP14P54578 494 aa22.77■■□□□ 1.24
NISCH-209ENST00000485765 KIF22Q14807 665 aa22.77■■□□□ 1.24
NISCH-209ENST00000485765 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.77■■□□□ 1.24
NISCH-209ENST00000485765 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa22.77■■□□□ 1.24
NISCH-209ENST00000485765 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
NISCH-209ENST00000485765 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.76■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.76■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 RILPL2Q969X0 211 aa22.76■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 FAM227BQ96M60 508 aa22.76■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.76■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 A0A1W2PRG0 241 aa22.75■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.75■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 SDSP20132 328 aa22.75■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 TDO2P48775 406 aa22.75■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.75■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 A0A0D9SFI3 127 aa22.74■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.74■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 TRIM47Q96LD4 638 aa22.74■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 HTTP42858 3142 aa22.73■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 RASA1P20936 1047 aa22.73■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 PSMC4P43686 418 aa22.73■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 ALX1Q15699 326 aa22.73■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.73■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 FEZ1Q99689 392 aa22.73■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.73■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 PRMT2P55345 433 aa22.72■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 VPS53Q5VIR6 699 aa22.72■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 NAPBQ9H115 298 aa22.72■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.72■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 TMX2Q9Y320 296 aa22.72■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 USP17L15C9J2P7 530 aa22.71■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.71■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 USP17L11C9JVI0 530 aa22.71■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 USP17L18D6R9N7 530 aa22.71■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 USP17L22D6RA61 530 aa22.71■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.71■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 USP17L19D6RCP7 530 aa22.71■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 USP17L20D6RJB6 530 aa22.71■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 USP17L24Q0WX57 530 aa22.71■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.71■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.71■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.71■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.71■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.71■■□□□ 1.23
NISCH-209ENST00000485765 VCAM1P19320 739 aa22.7■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 HERVK_113P62684 666 aa22.7■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 ICA1Q05084 483 aa22.7■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 PPARAQ07869 468 aa22.7■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 SRRDQ9UH36 339 aa22.7■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 HOXD10P28358 340 aa22.69■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 FCGRTP55899 365 aa22.69■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 TTC22Q5TAA0 569 aa22.69■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.69■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.69■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.69■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.69■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.69■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.69■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 HIP1O00291 1037 aa22.68■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 FGAP02671 866 aa22.68■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.68■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.68■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.67■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.67■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 RGS19P49795 217 aa22.67■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 PDE4BQ07343 736 aa22.67■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 LBX2Q6XYB7 198 aa22.67■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 LPAR1Q92633 364 aa22.67■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 ARMC5Q96C12 935 aa22.67■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 SH2D4AQ9H788 454 aa22.67■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 VCPKMTQ9H867 229 aa22.67■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.67■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 NYAP2Q9P242 653 aa22.67■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.66■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 ZMYM6O95789 1325 aa22.66■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 PRDM1O75626 825 aa22.66■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 FGRP09769 529 aa22.66■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 MYH8P13535 1937 aa22.66■■□□□ 1.22
NISCH-209ENST00000485765 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms