RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 SDSP20132 328 aa24.83■■□□□ 1.57
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NELFE-208ENST00000481121 IFFO2Q5TF58 517 aa24.83■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 STK11IPQ8N1F8 1099 aa24.83■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 ABHD8Q96I13 439 aa24.83■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 TRIM17Q9Y577 477 aa24.83■■□□□ 1.57
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NELFE-208ENST00000481121 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa24.81■■□□□ 1.56
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NELFE-208ENST00000481121 ZNF287Q9HBT7 754 aa24.81■■□□□ 1.56
NELFE-208ENST00000481121 EMILIN3Q9NT22 766 aa24.81■■□□□ 1.56
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NELFE-208ENST00000481121 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
NELFE-208ENST00000481121 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa24.79■■□□□ 1.56
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NELFE-208ENST00000481121 PDE4BQ07343 736 aa24.77■■□□□ 1.56
NELFE-208ENST00000481121 SH2D4AQ9H788 454 aa24.77■■□□□ 1.56
NELFE-208ENST00000481121 CENPFP49454 3210 aa24.77■■□□□ 1.56
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NELFE-208ENST00000481121 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
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NELFE-208ENST00000481121 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.75■■□□□ 1.55
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NELFE-208ENST00000481121 HPS5Q9UPZ3 1129 aa24.74■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 A0A0G2JMZ2 1700 aa24.74■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 RLFQ13129 1914 aa24.74■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 USP17L15C9J2P7 530 aa24.73■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 USP17L13C9JLJ4 530 aa24.73■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 USP17L11C9JVI0 530 aa24.73■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 USP17L18D6R9N7 530 aa24.73■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 USP17L22D6RA61 530 aa24.73■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 USP17L17D6RBQ6 530 aa24.73■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 USP17L19D6RCP7 530 aa24.73■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 USP17L20D6RJB6 530 aa24.73■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 GNRH1P01148 92 aa24.73■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 EEF2P13639 858 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 PSMC4P43686 418 aa24.73■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 HERVK_113P62684 666 aa24.73■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 CTDSPL2Q05D32 466 aa24.73■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 USP17L24Q0WX57 530 aa24.73■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.73■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 TMX2Q9Y320 296 aa24.73■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 PLIN4Q96Q06 1357 aa24.72■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 FGAP02671 866 aa24.72■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 SIAH1Q8IUQ4 282 aa24.72■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 TRIM47Q96LD4 638 aa24.72■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 ANAPC4Q9UJX5 808 aa24.72■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 DOCK3Q8IZD9 2030 aa24.72■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 CCDC85CA6NKD9 419 aa24.71■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 CTGFP29279 349 aa24.71■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 FCGRTP55899 365 aa24.71■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 LPAR1Q92633 364 aa24.71■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
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