RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
STRADBP1-201ENST00000478954 UBASH3BQ8TF42 649 aa7.85□□□□□ -1.15
STRADBP1-201ENST00000478954 DNAJC7Q99615 494 aa7.85□□□□□ -1.15
STRADBP1-201ENST00000478954 PCDH12Q9NPG4 1184 aa7.85□□□□□ -1.15
STRADBP1-201ENST00000478954 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa7.85□□□□□ -1.15
STRADBP1-201ENST00000478954 SAMD9Q5K651 1589 aa7.84□□□□□ -1.15
STRADBP1-201ENST00000478954 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa7.84□□□□□ -1.15
STRADBP1-201ENST00000478954 ADGBQ8N7X0 1667 aa7.84□□□□□ -1.15
STRADBP1-201ENST00000478954 APBA3O96018 575 aa7.84□□□□□ -1.15
STRADBP1-201ENST00000478954 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
STRADBP1-201ENST00000478954 CD68P34810 354 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
STRADBP1-201ENST00000478954 NLRP12P59046 1061 aa7.84□□□□□ -1.15
STRADBP1-201ENST00000478954 CHMP4BP1P59074 171 aa7.84□□□□□ -1.15
STRADBP1-201ENST00000478954 MBTPS1Q14703 1052 aa7.84□□□□□ -1.15
STRADBP1-201ENST00000478954 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC113Q9H0I3 377 aa7.84□□□□□ -1.15
STRADBP1-201ENST00000478954 OSGEPQ9NPF4 335 aa7.84□□□□□ -1.15
STRADBP1-201ENST00000478954 ST7Q9NRC1 585 aa7.84□□□□□ -1.15
STRADBP1-201ENST00000478954 FANCLQ9NW38 375 aa7.84□□□□□ -1.15
STRADBP1-201ENST00000478954 KLHL42Q9P2K6 505 aa7.84□□□□□ -1.15
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STRADBP1-201ENST00000478954 KIF14Q15058 1648 aa7.83□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 PROCP04070 461 aa7.83□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 GIPRP48546 466 aa7.83□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 ANAPC15P60006 121 aa7.83□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 RPS26P62854 115 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 C19orf57Q0VDD7 668 aa7.83□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 ADGRE1Q14246 886 aa7.83□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 IGF2-ASQ6U949 168 aa7.83□□□□□ -1.16
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STRADBP1-201ENST00000478954 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP7.83□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 KLHL23Q8NBE8 558 aa7.83□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 WNT8BQ93098 351 aa7.83□□□□□ -1.16
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STRADBP1-201ENST00000478954 NRSN2Q9GZP1 204 aa7.83□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa7.83□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 PLXNC1O60486 1568 aa7.83□□□□□ -1.16
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STRADBP1-201ENST00000478954 DNAJC6O75061 913 aa7.82□□□□□ -1.16
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STRADBP1-201ENST00000478954 B3GALT4O96024 378 aa7.82□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 CTSBP07858 339 aa7.82□□□□□ -1.16
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STRADBP1-201ENST00000478954 DDR2Q16832 855 aa7.82□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 TNNI3KQ59H18 835 aa7.82□□□□□ -1.16
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STRADBP1-201ENST00000478954 CDC45O75419 566 aa7.81□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 NOS3P29474 1203 aa7.81□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 GSTM4Q03013 218 aa7.81□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 DEFB132Q7Z7B7 95 aa7.81□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 GATAD2BQ8WXI9 593 aa7.81□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 SPOCK3Q9BQ16 436 aa7.81□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 TNKS2Q9H2K2 1166 aa7.81□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 SPC25Q9HBM1 224 aa7.81□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 TIAM1Q13009 1591 aa7.8□□□□□ -1.16
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STRADBP1-201ENST00000478954 ECEL1O95672 775 aa7.8□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 DLGAP3O95886 979 aa7.8□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 BMP6P22004 513 aa7.8□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 MCM4P33991 863 aa7.8□□□□□ -1.16
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STRADBP1-201ENST00000478954 SEPT6Q14141 434 aa7.8□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa7.8□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 ACAD11Q709F0 780 aa7.8□□□□□ -1.16
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STRADBP1-201ENST00000478954 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 BRMS1Q9HCU9 246 aa7.8□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 CHD4Q14839 1912 aa7.8□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 MSTNO14793 375 aa7.79□□□□□ -1.16
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STRADBP1-201ENST00000478954 ARL4DP49703 201 aa7.79□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 AMPD3Q01432 767 aa7.79□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 CLCQ05315 142 aa7.79□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 DUOXA2Q1HG44 320 aa7.79□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 FBXW10Q5XX13 1052 aa7.79□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 GGT6Q6P531 493 aa7.79□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
STRADBP1-201ENST00000478954 WFDC12Q8WWY7 111 aa7.79□□□□□ -1.16
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