RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-207ENST00000470201 NEDD1Q8NHV4 660 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-207ENST00000470201 TRIM11Q96F44 468 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC74BQ96LY2 380 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC6A18Q96N87 628 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-207ENST00000470201 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-207ENST00000470201 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-207ENST00000470201 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-207ENST00000470201 PIK3R2O00459 728 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-207ENST00000470201 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-207ENST00000470201 DNAJC6O75061 913 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-207ENST00000470201 CST3P01034 146 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-207ENST00000470201 NAT2P11245 290 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-207ENST00000470201 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-207ENST00000470201 ELNP15502 786 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-207ENST00000470201 TCEA2Q15560 299 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-207ENST00000470201 NKG7Q16617 165 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-207ENST00000470201 LONRF2Q1L5Z9 754 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM67Q5HYA8 995 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-207ENST00000470201 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-207ENST00000470201 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-207ENST00000470201 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-207ENST00000470201 KIF2CQ99661 725 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-207ENST00000470201 PIDD1Q9HB75 910 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-207ENST00000470201 SPC25Q9HBM1 224 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-207ENST00000470201 GNB5O14775 395 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 UBOX5O94941 541 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 GBP1P32455 592 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 FDX2Q6P4F2 183 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 DYMQ7RTS9 669 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 PPFIBP1Q86W92 1011 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM192Q8IY95 271 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 ISL2Q96A47 359 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 SGSM3Q96HU1 749 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 PLVAPQ9BX97 442 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 IFT57Q9NWB7 429 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 AGRPO00253 132 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 ADCY3O60266 1144 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 CLEC3AO75596 197 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 ASPAP45381 313 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 GYS2P54840 703 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 IGBP1P78318 339 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 TKFCQ3LXA3 575 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 UBE3DQ7Z6J8 389 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC26A8Q96RN1 970 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 FOXQ1Q9C009 403 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 LRIG2O94898 1065 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 DRD2P14416 443 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 MFSD2AQ8NA29 543 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 PLAAQ9Y263 795 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 F8W735 103 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM229AH3BQW9 127 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 ASMTLO95671 621 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM153BP0C7A2 387 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 ANAPC15P60006 121 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 SV2CQ496J9 727 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 PRRT3Q5FWE3 981 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 GPAT2Q6NUI2 795 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.359e-34■□□□□ 10.3
RABGGTB-207ENST00000470201 HAUS7Q99871 368 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 PCDH12Q9NPG4 1184 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 SUSD2Q9UGT4 822 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 C9IYK1 514 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 EPHX1P07099 455 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 APBA2Q99767 749 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 KLHL25Q9H0H3 589 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-207ENST00000470201 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa6.6□□□□□ -1.35
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