RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460330.5

PTGER3-209, Transcript of prostaglandin E receptor 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGER3, Length 1,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3-209ENST00000460330 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PTGER3-209ENST00000460330 FOXN1O15353 648 aa22.83■■□□□ 1.25
PTGER3-209ENST00000460330 ORC4O43929 436 aa22.83■■□□□ 1.25
PTGER3-209ENST00000460330 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PTGER3-209ENST00000460330 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.83■■□□□ 1.25
PTGER3-209ENST00000460330 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.83■■□□□ 1.25
PTGER3-209ENST00000460330 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.83■■□□□ 1.25
PTGER3-209ENST00000460330 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.83■■□□□ 1.25
PTGER3-209ENST00000460330 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.83■■□□□ 1.25
PTGER3-209ENST00000460330 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.83■■□□□ 1.25
PTGER3-209ENST00000460330 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PTGER3-209ENST00000460330 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.83■■□□□ 1.25
PTGER3-209ENST00000460330 A0A1W2PRG0 241 aa22.82■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 CA12O43570 354 aa22.82■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 ALDH1A1P00352 501 aa22.82■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 TFAP4Q01664 338 aa22.82■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.82■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.82■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.82■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.82■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 TSKSQ9UJT2 592 aa22.82■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 C19orf81C9J6K1 198 aa22.82■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 TSPY3P0CV98 308 aa22.82■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 TSPY8P0CW00 308 aa22.82■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 ICA1Q05084 483 aa22.82■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.82■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.82■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.82■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 PTPRFP10586 1907 aa22.81■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.81■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.81■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 FEZ1Q99689 392 aa22.81■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.81■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 TOMM22Q9NS69 142 aa22.81■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.81■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 PDHXO00330 501 aa22.8■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 TBC1D8O95759 1140 aa22.8■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 CYP21A2P08686 494 aa22.8■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 TREML2Q5T2D2 321 aa22.8■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.8■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 NEDD4P46934 1319 aa22.79■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 TSPY2A6NKD2 308 aa22.79■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.79■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 CEP95Q96GE4 821 aa22.79■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.79■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.79■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.79■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.78■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 USP14P54578 494 aa22.78■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 ATP2B2Q01814 1243 aa22.78■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.78■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.78■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 TMX2Q9Y320 296 aa22.78■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.78■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 LAMA4Q16363 1823 aa22.78■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 CRHR2Q13324 411 aa22.77■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 C12orf42Q96LP6 360 aa22.77■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.77■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 NYAP2Q9P242 653 aa22.77■■□□□ 1.24
PTGER3-209ENST00000460330 NMT2O60551 498 aa22.76■■□□□ 1.23
PTGER3-209ENST00000460330 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PTGER3-209ENST00000460330 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.76■■□□□ 1.23
PTGER3-209ENST00000460330 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.76■■□□□ 1.23
PTGER3-209ENST00000460330 NECTIN1Q15223 517 aa22.75■■□□□ 1.23
PTGER3-209ENST00000460330 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.75■■□□□ 1.23
PTGER3-209ENST00000460330 ESR2Q92731 530 aa22.75■■□□□ 1.23
PTGER3-209ENST00000460330 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.75■■□□□ 1.23
PTGER3-209ENST00000460330 KDM4AO75164 1064 aa22.74■■□□□ 1.23
PTGER3-209ENST00000460330 CYP2C8P10632 490 aa22.74■■□□□ 1.23
PTGER3-209ENST00000460330 LBX1P52954 281 aa22.74■■□□□ 1.23
PTGER3-209ENST00000460330 SH2D4AQ9H788 454 aa22.74■■□□□ 1.23
PTGER3-209ENST00000460330 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa22.74■■□□□ 1.23
PTGER3-209ENST00000460330 B4E1Z4 1266 aa22.74■■□□□ 1.23
PTGER3-209ENST00000460330 TTLL1O95922 423 aa22.74■■□□□ 1.23
PTGER3-209ENST00000460330 VCAM1P19320 739 aa22.74■■□□□ 1.23
PTGER3-209ENST00000460330 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PTGER3-209ENST00000460330 MKL1Q969V6 931 aa22.74■■□□□ 1.23
PTGER3-209ENST00000460330 KRT23Q9C075 422 aa22.74■■□□□ 1.23
PTGER3-209ENST00000460330 VCPKMTQ9H867 229 aa22.74■■□□□ 1.23
PTGER3-209ENST00000460330 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.74■■□□□ 1.23
PTGER3-209ENST00000460330 E7EWF7 191 aa22.73■■□□□ 1.23
PTGER3-209ENST00000460330 SLC27A2O14975 620 aa22.73■■□□□ 1.23
PTGER3-209ENST00000460330 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.73■■□□□ 1.23
PTGER3-209ENST00000460330 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.73■■□□□ 1.23
PTGER3-209ENST00000460330 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.73■■□□□ 1.23
PTGER3-209ENST00000460330 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.73■■□□□ 1.23
PTGER3-209ENST00000460330 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
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