RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 BCRP11274 1271 aa17.85■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 SDSP20132 328 aa17.85■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 CTGFP29279 349 aa17.85■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 FEZ1Q99689 392 aa17.85■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 TMOD4Q9NZQ9 345 aa17.85■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 TAOK2Q9UL54 1235 aa17.85■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 A0A1W2PRG0 241 aa17.84■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa17.84■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 TTC22Q5TAA0 569 aa17.84■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 USP17L2Q6R6M4 530 aa17.84■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM179Q6ZVK1 233 aa17.84■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 C12orf42Q96LP6 360 aa17.84■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 NAPBQ9H115 298 aa17.84■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
CSAG1-201ENST00000361211 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 RASA1P20936 1047 aa17.83■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 TICAM2Q86XR7 235 aa17.83■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC17Q96LX7 622 aa17.83■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 NACAP1Q9BZK3 213 aa17.83■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa17.83■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 EFCC1Q9HA90 598 aa17.83■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 PNMA3Q9UL41 463 aa17.83■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 HTTP42858 3142 aa17.83■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC171Q6TFL3 1326 aa17.82■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 PRDM1O75626 825 aa17.82■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 ICA1Q05084 483 aa17.82■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 PPARAQ07869 468 aa17.82■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP17.82■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 SIAH1Q8IUQ4 282 aa17.82■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP17.82■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 HPS5Q9UPZ3 1129 aa17.82■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 VCAM1P19320 739 aa17.81■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 OSBPP22059 807 aa17.81■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa17.81■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 SKAP1Q86WV1 359 aa17.81■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa17.81■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 TACC3Q9Y6A5 838 aa17.81■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 PEX10O60683 326 aa17.8■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 USP14P54578 494 aa17.8■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 CTDSPL2Q05D32 466 aa17.8■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 TRIM47Q96LD4 638 aa17.8■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 IL25Q9H293 177 aa17.8■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 MKNK2Q9HBH9 465 aa17.8■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa17.8■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 PTPN22Q9Y2R2 807 aa17.8■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC85CA6NKD9 419 aa17.79■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 EEF2P13639 858 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 PSMC4P43686 418 aa17.79■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 KIF22Q14807 665 aa17.79■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 ALX1Q15699 326 aa17.79■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 INCENPQ9NQS7 918 aa17.79■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 FGAP02671 866 aa17.78■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 HERVK_113P62684 666 aa17.78■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 FAM110CQ1W6H9 321 aa17.78■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 POTEEQ6S8J3 1075 aa17.78■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa17.78■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP17.78■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 TMX2Q9Y320 296 aa17.78■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa17.78■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 USP17L15C9J2P7 530 aa17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 USP17L13C9JLJ4 530 aa17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 USP17L11C9JVI0 530 aa17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 USP17L18D6R9N7 530 aa17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 USP17L22D6RA61 530 aa17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 USP17L17D6RBQ6 530 aa17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 USP17L19D6RCP7 530 aa17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 USP17L20D6RJB6 530 aa17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 HIP1O00291 1037 aa17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 ATP2B2Q01814 1243 aa17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 USP17L24Q0WX57 530 aa17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 VCPKMTQ9H867 229 aa17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 KANSL2Q9H9L4 492 aa17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 TXNRD2Q9NNW7 524 aa17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 ANAPC4Q9UJX5 808 aa17.77■□□□□ 0.44
CSAG1-201ENST00000361211 MGAMO43451 1857 aa17.77■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 ZMYM6O95789 1325 aa17.76■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 PDE4BQ07343 736 aa17.76■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 ARHGEF6Q15052 776 aa17.76■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 FAM47AQ5JRC9 791 aa17.76■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 SPICE1Q8N0Z3 855 aa17.76■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 PLIN4Q96Q06 1357 aa17.76■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
CSAG1-201ENST00000361211 FCGRTP55899 365 aa17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 626.6 ms