RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-201ENST00000344528 NLRX1Q86UT6 975 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-201ENST00000344528 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-201ENST00000344528 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-201ENST00000344528 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-201ENST00000344528 DNM2P50570 870 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-201ENST00000344528 VAV2P52735 878 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-201ENST00000344528 DPY19L2Q6NUT2 758 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-201ENST00000344528 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-201ENST00000344528 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
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SH3BP4-201ENST00000344528 MED23Q9ULK4 1368 aa18.22■□□□□ 0.51
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SH3BP4-201ENST00000344528 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-201ENST00000344528 SYT10Q6XYQ8 523 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-201ENST00000344528 DYMQ7RTS9 669 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-201ENST00000344528 CAPZA3Q96KX2 299 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP1R9BQ96SB3 815 aa18.22■□□□□ 0.51
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SH3BP4-201ENST00000344528 CYP26C1Q6V0L0 522 aa18.21■□□□□ 0.51
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SH3BP4-201ENST00000344528 MAP4K1Q92918 833 aa18.21■□□□□ 0.51
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SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF445P59923 1031 aa18.21■□□□□ 0.51
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SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF521Q96K83 1311 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP4-201ENST00000344528 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 SCG2P13521 617 aa18.21■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 NOX5Q96PH1 765 aa18.21■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 IWS1Q96ST2 819 aa18.21■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 ADORA1P30542 326 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 RBSNQ9H1K0 784 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 CBX8Q9HC52 389 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM37O94972 964 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 FERP16591 822 aa18.2■□□□□ 0.5
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SH3BP4-201ENST00000344528 KRT27Q7Z3Y8 459 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 GINS2Q9Y248 185 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP18.2■□□□□ 0.5
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SH3BP4-201ENST00000344528 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 PALD1Q9ULE6 856 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 UNC5CLQ8IV45 518 aa18.19■□□□□ 0.5
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SH3BP4-201ENST00000344528 IMPACTQ9P2X3 320 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 TPCN1Q9ULQ1 816 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 RXRBP28702 533 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 SNX16P57768 344 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 ADCY9O60503 1353 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 SPOPO43791 374 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 GCNT3O95395 438 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 OTUD6AQ7L8S5 288 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 JAKMIP2Q96AA8 810 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 PLA2R1Q13018 1463 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP18.18■□□□□ 0.5
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SH3BP4-201ENST00000344528 BRINP3Q76B58 766 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 MAEAQ7L5Y9 396 aa18.18■□□□□ 0.5
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SH3BP4-201ENST00000344528 SLC5A4Q9NY91 659 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 TCP10L2B9ZVM9 353 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 FBXO11Q86XK2 927 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 TMTC1Q8IUR5 882 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 LMBRD1Q9NUN5 540 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 ARAP3Q8WWN8 1544 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP1R7Q15435 360 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 NEK8Q86SG6 692 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 PIGBQ92521 554 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 IQCDQ96DY2 449 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 TET3O43151 1660 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 MCF2L2Q86YR7 1114 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 CHD1O14646 1710 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-201ENST00000344528 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa18.17■□□□□ 0.5
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