RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311101.9

PARL-201, Transcript of presenilin associated rhomboid like, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PARL, Length 1,240 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARL-201ENST00000311101 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
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PARL-201ENST00000311101 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
PARL-201ENST00000311101 MINDY4BA8MYZ0 360 aa23.8■■□□□ 1.4
PARL-201ENST00000311101 FOXP2O15409 715 aa23.8■■□□□ 1.4
PARL-201ENST00000311101 TDO2P48775 406 aa23.8■■□□□ 1.4
PARL-201ENST00000311101 USP17L2Q6R6M4 530 aa23.8■■□□□ 1.4
PARL-201ENST00000311101 IFNL3Q8IZI9 196 aa23.8■■□□□ 1.4
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PARL-201ENST00000311101 TMEM179Q6ZVK1 233 aa23.79■■□□□ 1.4
PARL-201ENST00000311101 CLEC10AQ8IUN9 316 aa23.79■■□□□ 1.4
PARL-201ENST00000311101 STK11IPQ8N1F8 1099 aa23.79■■□□□ 1.4
PARL-201ENST00000311101 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa23.79■■□□□ 1.4
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PARL-201ENST00000311101 A0A1W2PRG0 241 aa23.78■■□□□ 1.4
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PARL-201ENST00000311101 HELLSQ9NRZ9 838 aa23.78■■□□□ 1.4
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PARL-201ENST00000311101 PSMC4P43686 418 aa23.77■■□□□ 1.4
PARL-201ENST00000311101 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
PARL-201ENST00000311101 ARHGEF6Q15052 776 aa23.77■■□□□ 1.4
PARL-201ENST00000311101 VPS53Q5VIR6 699 aa23.77■■□□□ 1.4
PARL-201ENST00000311101 SIAH1Q8IUQ4 282 aa23.77■■□□□ 1.4
PARL-201ENST00000311101 TRIM47Q96LD4 638 aa23.77■■□□□ 1.4
PARL-201ENST00000311101 C12orf42Q96LP6 360 aa23.77■■□□□ 1.4
PARL-201ENST00000311101 NACAP1Q9BZK3 213 aa23.77■■□□□ 1.4
PARL-201ENST00000311101 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa23.77■■□□□ 1.4
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PARL-201ENST00000311101 TICAM2Q86XR7 235 aa23.76■■□□□ 1.39
PARL-201ENST00000311101 MYH8P13535 1937 aa23.76■■□□□ 1.39
PARL-201ENST00000311101 SDSP20132 328 aa23.75■■□□□ 1.39
PARL-201ENST00000311101 USP14P54578 494 aa23.75■■□□□ 1.39
PARL-201ENST00000311101 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa23.75■■□□□ 1.39
PARL-201ENST00000311101 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
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PARL-201ENST00000311101 NAPBQ9H115 298 aa23.75■■□□□ 1.39
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PARL-201ENST00000311101 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
PARL-201ENST00000311101 ICA1Q05084 483 aa23.74■■□□□ 1.39
PARL-201ENST00000311101 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP23.74■■□□□ 1.39
PARL-201ENST00000311101 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa23.74■■□□□ 1.39
PARL-201ENST00000311101 PEX10O60683 326 aa23.73■■□□□ 1.39
PARL-201ENST00000311101 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
PARL-201ENST00000311101 PPARAQ07869 468 aa23.73■■□□□ 1.39
PARL-201ENST00000311101 FAM110CQ1W6H9 321 aa23.73■■□□□ 1.39
PARL-201ENST00000311101 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa23.73■■□□□ 1.39
PARL-201ENST00000311101 POTEEQ6S8J3 1075 aa23.73■■□□□ 1.39
PARL-201ENST00000311101 MKNK2Q9HBH9 465 aa23.73■■□□□ 1.39
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PARL-201ENST00000311101 USP17L11C9JVI0 530 aa23.71■■□□□ 1.39
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PARL-201ENST00000311101 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.71■■□□□ 1.39
PARL-201ENST00000311101 USP17L19D6RCP7 530 aa23.71■■□□□ 1.39
PARL-201ENST00000311101 USP17L20D6RJB6 530 aa23.71■■□□□ 1.39
PARL-201ENST00000311101 EEF2P13639 858 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
PARL-201ENST00000311101 USP17L24Q0WX57 530 aa23.71■■□□□ 1.39
PARL-201ENST00000311101 TTC22Q5TAA0 569 aa23.71■■□□□ 1.39
PARL-201ENST00000311101 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa23.71■■□□□ 1.39
PARL-201ENST00000311101 KANSL2Q9H9L4 492 aa23.71■■□□□ 1.39
PARL-201ENST00000311101 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.71■■□□□ 1.39
PARL-201ENST00000311101 TXNRD2Q9NNW7 524 aa23.71■■□□□ 1.39
PARL-201ENST00000311101 SRRDQ9UH36 339 aa23.71■■□□□ 1.39
PARL-201ENST00000311101 TMX2Q9Y320 296 aa23.71■■□□□ 1.39
PARL-201ENST00000311101 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.39
PARL-201ENST00000311101 BRCA2P51587 3418 aa23.7■■□□□ 1.38
PARL-201ENST00000311101 CCDC171Q6TFL3 1326 aa23.7■■□□□ 1.38
PARL-201ENST00000311101 POTEFA5A3E0 1075 aa23.7■■□□□ 1.38
PARL-201ENST00000311101 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
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PARL-201ENST00000311101 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
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PARL-201ENST00000311101 ALX1Q15699 326 aa23.69■■□□□ 1.38
PARL-201ENST00000311101 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
PARL-201ENST00000311101 RBPJLQ9UBG7 517 aa23.69■■□□□ 1.38
PARL-201ENST00000311101 MORF4L1Q9UBU8 362 aa23.69■■□□□ 1.38
PARL-201ENST00000311101 MGAMO43451 1857 aa23.68■■□□□ 1.38
PARL-201ENST00000311101 MYPNQ86TC9 1320 aa23.68■■□□□ 1.38
PARL-201ENST00000311101 HOXD10P28358 340 aa23.68■■□□□ 1.38
PARL-201ENST00000311101 ATP2B2Q01814 1243 aa23.68■■□□□ 1.38
PARL-201ENST00000311101 PRKCZQ05513 592 aa23.68■■□□□ 1.38
PARL-201ENST00000311101 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
PARL-201ENST00000311101 SPICE1Q8N0Z3 855 aa23.68■■□□□ 1.38
PARL-201ENST00000311101 VCPKMTQ9H867 229 aa23.68■■□□□ 1.38
PARL-201ENST00000311101 ZNF287Q9HBT7 754 aa23.68■■□□□ 1.38
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