RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615007.4

LYNX1-208, Transcript of Ly6/neurotoxin 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LYNX1, Length 1,293 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LYNX1-208	ENST00000615007	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		32.81	■■■□□ 2.84
LYNX1-208	ENST00000615007	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		32.8	■■■□□ 2.84
LYNX1-208	ENST00000615007	C19orf81	C9J6K1	198 aa		32.8	■■■□□ 2.84
LYNX1-208	ENST00000615007	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
LYNX1-208	ENST00000615007	GDF11	O95390	407 aa		32.8	■■■□□ 2.84
LYNX1-208	ENST00000615007	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
LYNX1-208	ENST00000615007	MTMR2	Q13614	643 aa		32.8	■■■□□ 2.84
LYNX1-208	ENST00000615007	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		32.8	■■■□□ 2.84
LYNX1-208	ENST00000615007	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		32.8	■■■□□ 2.84
LYNX1-208	ENST00000615007	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		32.8	■■■□□ 2.84
LYNX1-208	ENST00000615007	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		32.8	■■■□□ 2.84
LYNX1-208	ENST00000615007	PDE6A	P16499	860 aa		32.79	■■■□□ 2.84
LYNX1-208	ENST00000615007	UBXN2A	P68543	259 aa		32.79	■■■□□ 2.84
LYNX1-208	ENST00000615007	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
LYNX1-208	ENST00000615007	BCL11A	Q9H165	835 aa		32.79	■■■□□ 2.84
LYNX1-208	ENST00000615007	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
LYNX1-208	ENST00000615007	GOLIM4	O00461	696 aa		32.78	■■■□□ 2.84
LYNX1-208	ENST00000615007	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
LYNX1-208	ENST00000615007	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
LYNX1-208	ENST00000615007	USP17L10	C9JJH3	530 aa		32.77	■■■□□ 2.84
LYNX1-208	ENST00000615007	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
LYNX1-208	ENST00000615007	COA7	Q96BR5	231 aa		32.77	■■■□□ 2.84
LYNX1-208	ENST00000615007	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
LYNX1-208	ENST00000615007	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		32.76	■■■□□ 2.83
LYNX1-208	ENST00000615007	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		32.76	■■■□□ 2.83
LYNX1-208	ENST00000615007	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		32.76	■■■□□ 2.83
LYNX1-208	ENST00000615007	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		32.76	■■■□□ 2.83
LYNX1-208	ENST00000615007	BRCA2	P51587	3418 aa		32.75	■■■□□ 2.83
LYNX1-208	ENST00000615007	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		32.75	■■■□□ 2.83
LYNX1-208	ENST00000615007	GABRQ	Q9UN88	632 aa		32.75	■■■□□ 2.83
LYNX1-208	ENST00000615007	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		32.75	■■■□□ 2.83
LYNX1-208	ENST00000615007	ATP5J	P18859	108 aa		32.74	■■■□□ 2.83
LYNX1-208	ENST00000615007	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
LYNX1-208	ENST00000615007	FLT3LG	P49771	235 aa		32.74	■■■□□ 2.83
LYNX1-208	ENST00000615007	JAG1	P78504	1218 aa		32.74	■■■□□ 2.83
LYNX1-208	ENST00000615007	IRF5	Q13568	498 aa		32.74	■■■□□ 2.83
LYNX1-208	ENST00000615007	MYH7	P12883	1935 aa		32.73	■■■□□ 2.83
LYNX1-208	ENST00000615007	GH2	P01242	217 aa		32.73	■■■□□ 2.83
LYNX1-208	ENST00000615007	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
LYNX1-208	ENST00000615007	MTFR1	Q15390	333 aa		32.73	■■■□□ 2.83
LYNX1-208	ENST00000615007	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		32.73	■■■□□ 2.83
LYNX1-208	ENST00000615007	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	32.73	■■■□□ 2.83
LYNX1-208	ENST00000615007	ADCY3	O60266	1144 aa		32.72	■■■□□ 2.83
LYNX1-208	ENST00000615007	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
LYNX1-208	ENST00000615007	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
LYNX1-208	ENST00000615007	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		32.71	■■■□□ 2.83
LYNX1-208	ENST00000615007	CABP5	Q9NP86	173 aa		32.71	■■■□□ 2.83
LYNX1-208	ENST00000615007	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		32.7	■■■□□ 2.83
LYNX1-208	ENST00000615007	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		32.7	■■■□□ 2.83
LYNX1-208	ENST00000615007	CCL5	P13501	91 aa		32.7	■■■□□ 2.83
LYNX1-208	ENST00000615007	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		32.7	■■■□□ 2.83
LYNX1-208	ENST00000615007	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	32.7	■■■□□ 2.83
LYNX1-208	ENST00000615007	HAUS7	Q99871	368 aa		32.7	■■■□□ 2.83
LYNX1-208	ENST00000615007	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		32.7	■■■□□ 2.83
LYNX1-208	ENST00000615007	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		32.69	■■■□□ 2.82
LYNX1-208	ENST00000615007	GCC1	Q96CN9	775 aa		32.69	■■■□□ 2.82
LYNX1-208	ENST00000615007	FEZ1	Q99689	392 aa		32.69	■■■□□ 2.82
LYNX1-208	ENST00000615007	RNF208	Q9H0X6	261 aa		32.69	■■■□□ 2.82
LYNX1-208	ENST00000615007	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		32.69	■■■□□ 2.82
LYNX1-208	ENST00000615007	GJB1	P08034	283 aa		32.68	■■■□□ 2.82
LYNX1-208	ENST00000615007	USP14	P54578	494 aa		32.68	■■■□□ 2.82
LYNX1-208	ENST00000615007	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
LYNX1-208	ENST00000615007	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		32.68	■■■□□ 2.82
LYNX1-208	ENST00000615007	SLC34A2	O95436	690 aa		32.67	■■■□□ 2.82
LYNX1-208	ENST00000615007	ADD2	P35612	726 aa		32.67	■■■□□ 2.82
LYNX1-208	ENST00000615007	GJA8	P48165	433 aa		32.67	■■■□□ 2.82
LYNX1-208	ENST00000615007	PLCD1	P51178	756 aa		32.67	■■■□□ 2.82
LYNX1-208	ENST00000615007	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		32.67	■■■□□ 2.82
LYNX1-208	ENST00000615007	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
LYNX1-208	ENST00000615007	MYH8	P13535	1937 aa		32.67	■■■□□ 2.82
LYNX1-208	ENST00000615007	HERVK_113	P62684	666 aa		32.66	■■■□□ 2.82
LYNX1-208	ENST00000615007	LCORL	Q8N3X6	602 aa		32.66	■■■□□ 2.82
LYNX1-208	ENST00000615007	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
LYNX1-208	ENST00000615007	ELN	P15502	786 aa		32.65	■■■□□ 2.82
LYNX1-208	ENST00000615007	CAPN2	P17655	700 aa		32.65	■■■□□ 2.82
LYNX1-208	ENST00000615007	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		32.65	■■■□□ 2.82
LYNX1-208	ENST00000615007	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		32.65	■■■□□ 2.82
LYNX1-208	ENST00000615007	C12orf42	Q96LP6	360 aa		32.65	■■■□□ 2.82
LYNX1-208	ENST00000615007	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
LYNX1-208	ENST00000615007	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		32.65	■■■□□ 2.82
LYNX1-208	ENST00000615007	INHA	P05111	366 aa		32.64	■■■□□ 2.82
LYNX1-208	ENST00000615007	SHMT1	P34896	483 aa		32.64	■■■□□ 2.82
LYNX1-208	ENST00000615007	GABPA	Q06546	454 aa		32.64	■■■□□ 2.82
LYNX1-208	ENST00000615007	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		32.64	■■■□□ 2.82
LYNX1-208	ENST00000615007	SHISA4	Q96DD7	197 aa		32.63	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	GPATCH3	Q96I76	525 aa		32.63	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		32.63	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	ARMT1	Q9H993	441 aa		32.63	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		32.63	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	UBE3C	Q15386	1083 aa		32.62	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		32.62	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		32.62	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		32.62	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	SWAP70	Q9UH65	585 aa		32.62	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	MBD4	O95243	580 aa		32.61	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		32.61	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	USP17L15	C9J2P7	530 aa		32.6	■■■□□ 2.81
LYNX1-208	ENST00000615007	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		32.6	■■■□□ 2.81

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