RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 STK36Q9NRP7 1315 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 RAD17O75943 681 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 MMP14P50281 582 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 RTN1Q16799 776 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 MCTP1Q6DN14 999 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 CDC37L1Q7L3B6 337 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 BCS1LQ9Y276 419 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 IFNAR1P17181 557 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 PICALMQ13492 652 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 CFAP100Q494V2 611 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 RCSD1Q6JBY9 416 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 CATIPQ7Z7H3 387 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 FANCBQ8NB91 859 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 MYL10Q9BUA6 226 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 EHD4Q9H223 541 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 SWAP70Q9UH65 585 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 HDAC9Q9UKV0 1011 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-207ENST00000589146 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 RXRAP19793 462 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP26.57■■□□□ 1.842e-8■■■□□ 16.5
CAPNS1-207ENST00000589146 CXCL9Q07325 125 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 KLHL34Q8N239 644 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 MTMR14Q8NCE2 650 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC44A5Q8NCS7 719 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 NEDD1Q8NHV4 660 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 IL17RBQ9NRM6 502 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 LMBRD1Q9NUN5 540 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 PLIN4Q96Q06 1357 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 TRAK2O60296 914 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 NOVP48745 357 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 TROAPQ12815 778 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 NFIAQ12857 509 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM87AQ8NBN3 555 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 NLGN2Q8NFZ4 835 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 JDP2Q8WYK2 163 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM198AQ9UFP1 575 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 H3BQV1 296 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 ENTPD3O75355 529 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 TSPY3P0CV98 308 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 TSPY8P0CW00 308 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 RESTQ13127 1097 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 IFFO2Q5TF58 517 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 CIAPIN1Q6FI81 312 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 MAP3K14Q99558 947 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 NMT2O60551 498 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 HLA-DOAP06340 250 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 SERPINB13Q9UIV8 391 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 SPDYE2BA6NHP3 402 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 SPDYE6P0CI01 402 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 TNIP1Q15025 636 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 NBPF11Q86T75 865 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 ATRNL1Q5VV63 1379 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 OGFOD1Q8N543 542 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 NUP133Q8WUM0 1156 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 CHAMP1Q96JM3 812 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-207ENST00000589146 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 ZFPM1Q8IX07 1006 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 WASF1Q92558 559 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 C8orf76Q96K31 380 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 SIPA1L1O43166 1804 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 RPS12P25398 132 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 FUT2Q10981 343 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 DLGAP5Q15398 846 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 KAT14Q9H8E8 782 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 PI4KBQ9UBF8 816 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 SHMT1P34896 483 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 FKBP1CQ5VVH2 108 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM22Q8IYM9 498 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 PHKBQ93100 1093 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 ALG1Q9BT22 464 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 FZD9O00144 591 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 SPDYE2Q495Y8 402 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-207ENST00000589146 TMTC3Q6ZXV5 915 aa26.48■■□□□ 1.83
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