RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
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CTIF-205ENST00000587860 NBPF11Q86T75 865 aa17.29■□□□□ 0.36
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CTIF-205ENST00000587860 A0A1W2PQ27 194 aa17.29■□□□□ 0.36
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CTIF-205ENST00000587860 A0A1W2PQD8 194 aa17.29■□□□□ 0.36
CTIF-205ENST00000587860 CMA1P23946 247 aa17.29■□□□□ 0.36
CTIF-205ENST00000587860 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
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CTIF-205ENST00000587860 LIFRP42702 1097 aa17.27■□□□□ 0.35
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CTIF-205ENST00000587860 FAM193AP78312 1265 aa17.27■□□□□ 0.35
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CTIF-205ENST00000587860 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
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CTIF-205ENST00000587860 RAD21O60216 631 aa17.25■□□□□ 0.35
CTIF-205ENST00000587860 USP17L8P0C7I0 530 aa17.25■□□□□ 0.35
CTIF-205ENST00000587860 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP17.25■□□□□ 0.35
CTIF-205ENST00000587860 ZNF174Q15697 407 aa17.25■□□□□ 0.35
CTIF-205ENST00000587860 DYNLL2Q96FJ2 89 aa17.25■□□□□ 0.35
CTIF-205ENST00000587860 CPVLQ9H3G5 476 aa17.25■□□□□ 0.35
CTIF-205ENST00000587860 CNNM2Q9H8M5 875 aa17.25■□□□□ 0.35
CTIF-205ENST00000587860 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
CTIF-205ENST00000587860 GYS2P54840 703 aa17.25■□□□□ 0.35
CTIF-205ENST00000587860 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
CTIF-205ENST00000587860 KLHL10Q6JEL2 608 aa17.25■□□□□ 0.35
CTIF-205ENST00000587860 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
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CTIF-205ENST00000587860 SLC44A5Q8NCS7 719 aa17.24■□□□□ 0.35
CTIF-205ENST00000587860 ESR2Q92731 530 aa17.24■□□□□ 0.35
CTIF-205ENST00000587860 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa17.24■□□□□ 0.35
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CTIF-205ENST00000587860 STX17P56962 302 aa17.24■□□□□ 0.35
CTIF-205ENST00000587860 CCZ1BP86790 482 aa17.24■□□□□ 0.35
CTIF-205ENST00000587860 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
CTIF-205ENST00000587860 CFAP100Q494V2 611 aa17.24■□□□□ 0.35
CTIF-205ENST00000587860 DHX58Q96C10 678 aa17.24■□□□□ 0.35
CTIF-205ENST00000587860 NLRP3Q96P20 1036 aa17.24■□□□□ 0.35
CTIF-205ENST00000587860 CSRNP2Q9H175 543 aa17.24■□□□□ 0.35
CTIF-205ENST00000587860 HSD3B7Q9H2F3 369 aa17.24■□□□□ 0.35
CTIF-205ENST00000587860 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
CTIF-205ENST00000587860 FANCCQ00597 558 aa17.23■□□□□ 0.35
CTIF-205ENST00000587860 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa17.23■□□□□ 0.35
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