RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566059.5

SPNS1-208, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 1,615 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-208ENST00000566059 SWAP70Q9UH65 585 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-208ENST00000566059 SGSM2O43147 1006 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-208ENST00000566059 CDK8P49336 464 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-208ENST00000566059 PPATQ06203 517 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-208ENST00000566059 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-208ENST00000566059 IRF6O14896 467 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-208ENST00000566059 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-208ENST00000566059 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-208ENST00000566059 ROBO3Q96MS0 1386 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-208ENST00000566059 PPARAQ07869 468 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-208ENST00000566059 PPIL2Q13356 520 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-208ENST00000566059 DSCC1Q9BVC3 393 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-208ENST00000566059 ZHX2Q9Y6X8 837 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-208ENST00000566059 ZMYM6O95789 1325 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-208ENST00000566059 THSD7BQ9C0I4 1608 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-208ENST00000566059 GH2P01242 217 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-208ENST00000566059 ASNSP08243 561 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-208ENST00000566059 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-208ENST00000566059 DOCK1Q14185 1865 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-208ENST00000566059 CDC45O75419 566 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS1-208ENST00000566059 ABCB5Q2M3G0 1257 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS1-208ENST00000566059 MS4A4AQ96JQ5 239 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS1-208ENST00000566059 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS1-208ENST00000566059 GINM1Q9NU53 330 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS1-208ENST00000566059 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS1-208ENST00000566059 USP17L5A8MUK1 530 aa21.33■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 CTDSPL2Q05D32 466 aa21.33■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 ANAPC4Q9UJX5 808 aa21.33■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 KCNH4Q9UQ05 1017 aa21.33■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 PTH1RQ03431 593 aa21.32■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 AKR1B1P15121 316 aa21.31■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 RASA1P20936 1047 aa21.31■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 GUCY1A2P33402 732 aa21.31■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 TM4SF4P48230 202 aa21.31■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 GTF2A2P52657 109 aa21.31■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 MKNK2Q9HBH9 465 aa21.31■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 TACC3Q9Y6A5 838 aa21.31■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 LAMB1P07942 1786 aa21.31■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 CXCL11O14625 94 aa21.3■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 PRDM1O75626 825 aa21.3■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 HAND2P61296 217 aa21.3■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 SNAPC2Q13487 334 aa21.3■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 CCDC17Q96LX7 622 aa21.3■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 CABP5Q9NP86 173 aa21.3■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 INCENPQ9NQS7 918 aa21.3■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 ATAD5Q96QE3 1844 aa21.3■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 TRIM75PA6NK02 468 aa21.29■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 INHBEP58166 350 aa21.29■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 PDE4BQ07343 736 aa21.29■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 SREBF2Q12772 1141 aa21.29■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 SPP2Q13103 211 aa21.29■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 SEPT2Q15019 361 aa21.29■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 RAB3GAP1Q15042 981 aa21.29■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF280CQ8ND82 737 aa21.29■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 BRI3BPQ8WY22 251 aa21.29■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 PTPN18Q99952 460 aa21.29■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 WDR18Q9BV38 432 aa21.29■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 NBPF3Q9H094 633 aa21.29■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF287Q9HBT7 754 aa21.29■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 WBP1LQ9NX94 342 aa21.29■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 CASC1Q6TDU7 716 aa21.29■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 TBC1D2Q9BYX2 928 aa21.29■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 CTNNA3Q9UI47 895 aa21.29■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP21.29■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 PHIPQ8WWQ0 1821 aa21.28■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa21.28■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF213O14771 459 aa21.28■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 CETPP11597 493 aa21.28■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 CCL15Q16663 113 aa21.28■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 TMEM179Q6ZVK1 233 aa21.28■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 MAP4K1Q92918 833 aa21.28■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 AS3MTQ9HBK9 375 aa21.28■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP21.27■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 FGRP09769 529 aa21.27■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 MOGSQ13724 837 aa21.27■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.27■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
SPNS1-208ENST00000566059 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
SPNS1-208ENST00000566059 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.26■□□□□ 0.99
SPNS1-208ENST00000566059 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
SPNS1-208ENST00000566059 IFNL1Q8IU54 200 aa21.26■□□□□ 0.99
SPNS1-208ENST00000566059 TBC1D10CQ8IV04 446 aa21.26■□□□□ 0.99
SPNS1-208ENST00000566059 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
SPNS1-208ENST00000566059 SIAH1Q8IUQ4 282 aa21.26■□□□□ 0.99
SPNS1-208ENST00000566059 ACER1Q8TDN7 264 aa21.26■□□□□ 0.99
SPNS1-208ENST00000566059 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
SPNS1-208ENST00000566059 ORC4O43929 436 aa21.25■□□□□ 0.99
SPNS1-208ENST00000566059 BACE1P56817 501 aa21.25■□□□□ 0.99
SPNS1-208ENST00000566059 FAM47AQ5JRC9 791 aa21.25■□□□□ 0.99
SPNS1-208ENST00000566059 AKNAD1Q5T1N1 836 aa21.25■□□□□ 0.99
SPNS1-208ENST00000566059 CLEC10AQ8IUN9 316 aa21.25■□□□□ 0.99
SPNS1-208ENST00000566059 STAG1Q8WVM7 1258 aa21.25■□□□□ 0.99
SPNS1-208ENST00000566059 ANO2Q9NQ90 1003 aa21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.7 ms