RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547449.1

CS-209, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-209ENST00000547449 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 GDPD2Q9HCC8 539 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 IL17RBQ9NRM6 502 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 CD2APQ9Y5K6 639 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 SLX4Q8IY92 1834 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 YDJCA8MPS7 323 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 DEXIO95424 95 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 RASA1P20936 1047 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 NOVP48745 357 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 SCNN1DP51172 638 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 GABPAQ06546 454 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 FAM173BQ6P4H8 233 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 BRAPQ7Z569 592 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 TRIM22Q8IYM9 498 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 KLHL34Q8N239 644 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 NUP133Q8WUM0 1156 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 SGIP1Q9BQI5 828 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 IDI2Q9BXS1 227 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 RCOR1Q9UKL0 485 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 MYH13Q9UKX3 1938 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 MYO3BQ8WXR4 1341 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 FSD2A1L4K1 749 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 FIBPO43427 364 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 PPFIA3O75145 1194 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 VIL1P09327 827 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 TSPY3P0CV98 308 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 TSPY8P0CW00 308 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 ZNF445P59923 1031 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 FUT2Q10981 343 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 KRT40Q6A162 431 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 KIAA0825Q8IV33 1275 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 LARGE2Q8N3Y3 721 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP11.35□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 PHKBQ93100 1093 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 SLC26A6Q9BXS9 759 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 SWAP70Q9UH65 585 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 NMT2O60551 498 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 KIF5BP33176 963 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 GUCY1B3Q02153 619 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 TRIM29Q14134 588 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 TMTC3Q6ZXV5 915 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 SLC44A5Q8NCS7 719 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 SPATA32Q96LK8 384 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 GMLQ99445 158 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 EHD4Q9H223 541 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 KAT14Q9H8E8 782 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 ZNRF3Q9ULT6 936 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-209ENST00000547449 HLA-DOAP06340 250 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-209ENST00000547449 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP11.33□□□□□ -0.6
CS-209ENST00000547449 GNAQP50148 359 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-209ENST00000547449 FOSBP53539 338 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-209ENST00000547449 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
CS-209ENST00000547449 PICALMQ13492 652 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-209ENST00000547449 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-209ENST00000547449 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
CS-209ENST00000547449 LZTS2Q9BRK4 669 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-209ENST00000547449 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
CS-209ENST00000547449 RTEL1Q9NZ71 1219 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-209ENST00000547449 TMEM63CQ9P1W3 806 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-209ENST00000547449 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-209ENST00000547449 ENTPD3O75355 529 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-209ENST00000547449 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CS-209ENST00000547449 TOP1P11387 765 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CS-209ENST00000547449 GUCY1A2P33402 732 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-209ENST00000547449 MMP14P50281 582 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-209ENST00000547449 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP11.32□□□□□ -0.6
CS-209ENST00000547449 NFIAQ12857 509 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-209ENST00000547449 GRM4Q14833 912 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-209ENST00000547449 PKN1Q16512 942 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-209ENST00000547449 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-209ENST00000547449 CFAP100Q494V2 611 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-209ENST00000547449 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CS-209ENST00000547449 MYSM1Q5VVJ2 828 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-209ENST00000547449 NIM1KQ8IY84 436 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-209ENST00000547449 PNMA1Q8ND90 353 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-209ENST00000547449 AGBL3Q8NEM8 1001 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-209ENST00000547449 CCDC17Q96LX7 622 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-209ENST00000547449 AIFM3Q96NN9 605 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-209ENST00000547449 USP28Q96RU2 1077 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-209ENST00000547449 TMEM47Q9BQJ4 181 aa11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms