RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542322.5

GRAMD2B-218, Transcript of GRAM domain containing 2B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GRAMD2B, Length 2,977 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD2B-218ENST00000542322 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa20.6■□□□□ 0.89
GRAMD2B-218ENST00000542322 CAVIN2O95810 425 aa20.6■□□□□ 0.89
GRAMD2B-218ENST00000542322 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
GRAMD2B-218ENST00000542322 SHISA4Q96DD7 197 aa20.6■□□□□ 0.89
GRAMD2B-218ENST00000542322 PRIMPOLQ96LW4 560 aa20.6■□□□□ 0.89
GRAMD2B-218ENST00000542322 CSRNP2Q9H175 543 aa20.6■□□□□ 0.89
GRAMD2B-218ENST00000542322 CPVLQ9H3G5 476 aa20.6■□□□□ 0.89
GRAMD2B-218ENST00000542322 MYH15Q9Y2K3 1946 aa20.6■□□□□ 0.89
GRAMD2B-218ENST00000542322 SPDYE4A6NLX3 237 aa20.6■□□□□ 0.89
GRAMD2B-218ENST00000542322 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP20.6■□□□□ 0.89
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GRAMD2B-218ENST00000542322 WASF1Q92558 559 aa20.6■□□□□ 0.89
GRAMD2B-218ENST00000542322 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa20.6■□□□□ 0.89
GRAMD2B-218ENST00000542322 UBASH3AP57075 661 aa20.59■□□□□ 0.89
GRAMD2B-218ENST00000542322 UBE4AQ14139 1066 aa20.59■□□□□ 0.89
GRAMD2B-218ENST00000542322 NFIXQ14938 502 aa20.59■□□□□ 0.89
GRAMD2B-218ENST00000542322 KRBA2Q6ZNG9 492 aa20.59■□□□□ 0.89
GRAMD2B-218ENST00000542322 ZNF710Q8N1W2 664 aa20.59■□□□□ 0.89
GRAMD2B-218ENST00000542322 SLC44A5Q8NCS7 719 aa20.59■□□□□ 0.89
GRAMD2B-218ENST00000542322 PDCL3Q9H2J4 239 aa20.59■□□□□ 0.89
GRAMD2B-218ENST00000542322 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
GRAMD2B-218ENST00000542322 MYH2Q9UKX2 1941 aa20.59■□□□□ 0.89
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GRAMD2B-218ENST00000542322 RASGRP4Q8TDF6 673 aa20.59■□□□□ 0.89
GRAMD2B-218ENST00000542322 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
GRAMD2B-218ENST00000542322 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
GRAMD2B-218ENST00000542322 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
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GRAMD2B-218ENST00000542322 ADAMTS3O15072 1205 aa20.58■□□□□ 0.89
GRAMD2B-218ENST00000542322 RFC4P35249 363 aa20.58■□□□□ 0.89
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GRAMD2B-218ENST00000542322 RESP18Q5W5W9 173 aa20.58■□□□□ 0.89
GRAMD2B-218ENST00000542322 VWA3AA6NCI4 1184 aa20.58■□□□□ 0.89
GRAMD2B-218ENST00000542322 CEP135Q66GS9 1140 aa20.58■□□□□ 0.89
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GRAMD2B-218ENST00000542322 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 TERF1P54274 439 aa20.58■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 PTPN14Q15678 1187 aa20.58■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.58■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 CUTAO60888 179 aa20.57■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 NCAPHQ15003 741 aa20.57■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 SARM1Q6SZW1 724 aa20.57■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 STX8Q9UNK0 236 aa20.57■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 PPP6R2O75170 966 aa20.57■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 CCZ1BP86790 482 aa20.57■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 ARMCX5Q6P1M9 558 aa20.57■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa20.57■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 PLIN2Q99541 437 aa20.57■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 ZNF804BA4D1E1 1349 aa20.57■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 BMP6P22004 513 aa20.56■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 MCM7P33993 719 aa20.56■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 CCDC112Q8NEF3 446 aa20.56■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 GOLGA8HP0CJ92 632 aa20.56■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 HOMER1Q86YM7 354 aa20.56■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 C4AP0C0L4 1744 aa20.56■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 C4BP0C0L5 1744 aa20.56■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 NLRP5P59047 1200 aa20.55■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 SEC23AQ15436 765 aa20.55■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa20.55■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 USP17L3A6NCW0 530 aa20.55■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 USP17L4A6NCW7 530 aa20.55■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 CBX1P83916 185 aa20.55■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 MYL5Q02045 173 aa20.55■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 POSTNQ15063 836 aa20.55■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 CLEC4GQ6UXB4 293 aa20.55■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.55■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 USP17L1Q7RTZ2 530 aa20.55■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 CPLX3Q8WVH0 158 aa20.55■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 BLZF1Q9H2G9 400 aa20.55■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 USP21Q9UK80 565 aa20.55■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa20.55■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 SMTNL1A8MU46 457 aa20.55■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 HPSEQ9Y251 543 aa20.55■□□□□ 0.88
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GRAMD2B-218ENST00000542322 F8W031 263 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 XBP1P17861 261 aa20.54■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 KRT2P35908 639 aa20.54■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 RILPL1Q5EBL4 403 aa20.54■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 TMTC2Q8N394 836 aa20.54■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.54■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa20.54■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 MKNK2Q9HBH9 465 aa20.54■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 TFAP4Q01664 338 aa20.54■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 SMARCE1Q969G3 411 aa20.54■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 PKN1Q16512 942 aa20.53■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.53■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 VAT1LQ9HCJ6 419 aa20.53■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 NARFQ9UHQ1 456 aa20.53■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 MAN1B1Q9UKM7 699 aa20.53■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
GRAMD2B-218ENST00000542322 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
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