RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADGRE1Q14246 886 aa12.82□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM31Q5JXX7 168 aa12.82□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AKNAD1Q5T1N1 836 aa12.82□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BEND3Q5T5X7 828 aa12.82□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DOCK1Q14185 1865 aa12.82□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DOCK2Q92608 1830 aa12.81□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MSCO60682 206 aa12.81□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BMP1P13497 986 aa12.81□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAG1P15918 1043 aa12.81□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCNQ1P51787 676 aa12.81□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ERVK-9P63128 1117 aa12.81□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ERVK-24P63145 666 aa12.81□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATP2B2Q01814 1243 aa12.81□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAP2K5Q13163 448 aa12.81□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRPV1Q8NER1 839 aa12.81□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLHDC4Q8TBB5 520 aa12.81□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SUCLG2Q96I99 432 aa12.81□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IDI2Q9BXS1 227 aa12.81□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMOD4Q9NZQ9 345 aa12.81□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 USP17L5A8MUK1 530 aa12.8□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VGLL2Q8N8G2 317 aa12.8□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARRDC4Q8NCT1 418 aa12.8□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PBX4Q9BYU1 374 aa12.8□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHD7Q9P2D1 2997 aa12.79□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FRMPD3Q5JV73 1810 aa12.79□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FPGSQ05932 587 aa12.79□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RALBP1Q15311 655 aa12.79□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TACC3Q9Y6A5 838 aa12.79□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UTYO14607 1347 aa12.79□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MYO9BQ13459 2157 aa12.79□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLTBP09497 229 aa12.78□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRE11P49959 708 aa12.78□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SH3D19Q5HYK7 790 aa12.78□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC4A10Q6U841 1118 aa12.78□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KAZALD1Q96I82 304 aa12.78□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AS3MTQ9HBK9 375 aa12.78□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LOC285556D6RIA3 1793 aa12.77□□□□□ -0.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CAP2P40123 477 aa12.77□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BTDP43251 543 aa12.77□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BACE1P56817 501 aa12.77□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SNX17Q15036 470 aa12.77□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NPLOC4Q8TAT6 608 aa12.77□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP12.77□□□□□ -0.373e-6■□□□□ 10.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM39AQ9NV64 488 aa12.77□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RLFQ13129 1914 aa12.76□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TBC1D12O60347 775 aa12.76□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC5A1P13866 664 aa12.76□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FGFR2P21802 821 aa12.76□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP12.76□□□□□ -0.374e-7■■□□□ 13.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TBC1D2Q9BYX2 928 aa12.76□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WDFY4Q6ZS81 3184 aa12.75□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CYBAP13498 195 aa12.75□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTPREP23469 700 aa12.75□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RFX7Q2KHR2 1363 aa12.75□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa12.75□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C11orf16Q9NQ32 467 aa12.75□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABCF2Q9UG63 623 aa12.75□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa12.75□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC15A5A6NIM6 579 aa12.74□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIAA0355O15063 1070 aa12.74□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 JAG1P78504 1218 aa12.74□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRRC41Q15345 812 aa12.74□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AAK1Q2M2I8 961 aa12.74□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LPIN2Q92539 896 aa12.74□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa12.74□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GAKO14976 1311 aa12.73□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIF16BQ96L93 1317 aa12.73□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CNMDO75829 334 aa12.73□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACRP10323 421 aa12.73□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCNA1P78396 465 aa12.73□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM47AQ5JRC9 791 aa12.73□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DPP9Q86TI2 863 aa12.73□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC44A5Q8NCS7 719 aa12.73□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UIMC1Q96RL1 719 aa12.73□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WDR18Q9BV38 432 aa12.73□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MSRAQ9UJ68 235 aa12.73□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa12.72□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 USP17L10C9JJH3 530 aa12.72□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMIM22K7EJ46 135 aa12.72□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SEPT4O43236 478 aa12.72□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPR37L1O60883 481 aa12.72□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GDF11O95390 407 aa12.72□□□□□ -0.37
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PHKA1P46020 1223 aa12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms