RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504936.1

PITX1-204, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 2

Gene PITX1, Length 770 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-204ENST00000504936 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.78■■□□□ 1.24
PITX1-204ENST00000504936 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.77■■□□□ 1.24
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PITX1-204ENST00000504936 CXCL11O14625 94 aa22.77■■□□□ 1.24
PITX1-204ENST00000504936 GH2P01242 217 aa22.77■■□□□ 1.24
PITX1-204ENST00000504936 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PITX1-204ENST00000504936 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PITX1-204ENST00000504936 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.77■■□□□ 1.24
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PITX1-204ENST00000504936 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.77■■□□□ 1.24
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PITX1-204ENST00000504936 CABP5Q9NP86 173 aa22.77■■□□□ 1.24
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PITX1-204ENST00000504936 BTBD19C9JJ37 291 aa22.76■■□□□ 1.23
PITX1-204ENST00000504936 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.76■■□□□ 1.23
PITX1-204ENST00000504936 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.76■■□□□ 1.23
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PITX1-204ENST00000504936 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.76■■□□□ 1.23
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PITX1-204ENST00000504936 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
PITX1-204ENST00000504936 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
PITX1-204ENST00000504936 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
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PITX1-204ENST00000504936 PNMA3Q9UL41 463 aa22.67■■□□□ 1.22
PITX1-204ENST00000504936 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.66■■□□□ 1.22
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