RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503051.1

USP46-AS1-201, USP46 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene USP46-AS1, Length 1,048 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-AS1-201ENST00000503051 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa23.18■■□□□ 1.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 DNAJC18Q9H819 358 aa23.18■■□□□ 1.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 PNMA3Q9UL41 463 aa23.18■■□□□ 1.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa23.18■■□□□ 1.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa23.18■■□□□ 1.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 GDF11O95390 407 aa23.17■■□□□ 1.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 CAP1Q01518 475 aa23.17■■□□□ 1.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 NUCB1Q02818 461 aa23.17■■□□□ 1.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 SLFNL1Q499Z3 407 aa23.17■■□□□ 1.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 GNRH1P01148 92 aa23.16■■□□□ 1.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 HMGCS2P54868 508 aa23.16■■□□□ 1.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 TTC6Q86TZ1 520 aa23.16■■□□□ 1.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.16■■□□□ 1.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 KBTBD3Q8NAB2 608 aa23.16■■□□□ 1.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 SERPINB13Q9UIV8 391 aa23.16■■□□□ 1.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa23.16■■□□□ 1.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 DOCK3Q8IZD9 2030 aa23.15■■□□□ 1.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 CHGBP05060 677 aa23.15■■□□□ 1.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP23.15■■□□□ 1.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 UBE3CQ15386 1083 aa23.15■■□□□ 1.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa23.15■■□□□ 1.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa23.15■■□□□ 1.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 GINM1Q9NU53 330 aa23.15■■□□□ 1.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 STAP2Q9UGK3 403 aa23.15■■□□□ 1.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa23.15■■□□□ 1.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 PSMC4P43686 418 aa23.14■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 PDE1AP54750 535 aa23.14■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 MTMR2Q13614 643 aa23.14■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 TREML2Q5T2D2 321 aa23.14■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 LCORLQ8N3X6 602 aa23.14■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 EHD4Q9H223 541 aa23.14■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMOD4Q9NZQ9 345 aa23.14■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 MBD4O95243 580 aa23.13■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 HOXD10P28358 340 aa23.13■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 NBPF11Q86T75 865 aa23.13■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 MCM9Q9NXL9 1143 aa23.13■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 BCRP11274 1271 aa23.12■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 PRMT2P55345 433 aa23.12■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 FCGRTP55899 365 aa23.12■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 SDR42E1Q8WUS8 393 aa23.12■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 ARMT1Q9H993 441 aa23.12■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 GH2P01242 217 aa23.11■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 OSBPP22059 807 aa23.11■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 ARMC5Q96C12 935 aa23.11■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 WDR18Q9BV38 432 aa23.11■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 MYPNQ86TC9 1320 aa23.1■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 AMOTL1Q8IY63 956 aa23.1■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 RAET1EQ8TD07 263 aa23.1■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.1■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRIM47Q96LD4 638 aa23.1■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 FEZ1Q99689 392 aa23.1■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 FSD1Q9BTV5 496 aa23.1■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 USP17L10C9JJH3 530 aa23.09■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 BACE1P56817 501 aa23.09■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 RAB3GAP1Q15042 981 aa23.09■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 SH3D19Q5HYK7 790 aa23.09■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa23.09■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 CABP5Q9NP86 173 aa23.09■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 SRRDQ9UH36 339 aa23.09■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 C19orf81C9J6K1 198 aa23.08■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 CTGFP29279 349 aa23.08■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 PLCD1P51178 756 aa23.08■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 JAG1P78504 1218 aa23.08■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 ABCB5Q2M3G0 1257 aa23.08■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 TATDN1Q6P1N9 297 aa23.08■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 APPBP2Q92624 585 aa23.08■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMEM106CQ9BVX2 250 aa23.08■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa23.08■■□□□ 1.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 HTTP42858 3142 aa23.07■■□□□ 1.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa23.07■■□□□ 1.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF333Q96JL9 665 aa23.07■■□□□ 1.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 PRKAB2O43741 272 aa23.06■■□□□ 1.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 MYCP01106 439 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM110CQ1W6H9 321 aa23.06■■□□□ 1.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 SH3TC2Q8TF17 1288 aa23.06■■□□□ 1.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 OSBP2Q969R2 916 aa23.06■■□□□ 1.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa23.06■■□□□ 1.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 SHMT1P34896 483 aa23.05■■□□□ 1.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 USP17L2Q6R6M4 530 aa23.05■■□□□ 1.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 EVI5LQ96CN4 794 aa23.05■■□□□ 1.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms