RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PSPC1-204ENST00000492741 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
PSPC1-204ENST00000492741 TAOK2Q9UL54 1235 aa25.93■■□□□ 1.74
PSPC1-204ENST00000492741 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
PSPC1-204ENST00000492741 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa25.92■■□□□ 1.74
PSPC1-204ENST00000492741 POTECB2RU33 542 aa25.92■■□□□ 1.74
PSPC1-204ENST00000492741 SHMT1P34896 483 aa25.92■■□□□ 1.74
PSPC1-204ENST00000492741 SLC4A3P48751 1232 aa25.92■■□□□ 1.74
PSPC1-204ENST00000492741 CDAN1Q8IWY9 1227 aa25.92■■□□□ 1.74
PSPC1-204ENST00000492741 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
PSPC1-204ENST00000492741 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
PSPC1-204ENST00000492741 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
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PSPC1-204ENST00000492741 MIGA2Q7L4E1 593 aa25.91■■□□□ 1.74
PSPC1-204ENST00000492741 SULF1Q8IWU6 871 aa25.91■■□□□ 1.74
PSPC1-204ENST00000492741 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa25.91■■□□□ 1.74
PSPC1-204ENST00000492741 DNAJC18Q9H819 358 aa25.91■■□□□ 1.74
PSPC1-204ENST00000492741 RRAGCQ9HB90 399 aa25.91■■□□□ 1.74
PSPC1-204ENST00000492741 SCN4AP35499 1836 aa25.91■■□□□ 1.74
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PSPC1-204ENST00000492741 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
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PSPC1-204ENST00000492741 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PSPC1-204ENST00000492741 MTA3Q9BTC8 594 aa25.91■■□□□ 1.74
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PSPC1-204ENST00000492741 APOBRQ0VD83 1088 aa25.9■■□□□ 1.74
PSPC1-204ENST00000492741 FBXL16Q8N461 479 aa25.9■■□□□ 1.74
PSPC1-204ENST00000492741 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
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PSPC1-204ENST00000492741 TEPSINQ96N21 525 aa25.9■■□□□ 1.74
PSPC1-204ENST00000492741 AGXT2Q9BYV1 514 aa25.9■■□□□ 1.74
PSPC1-204ENST00000492741 PGAP2Q9UHJ9 254 aa25.9■■□□□ 1.74
PSPC1-204ENST00000492741 CLEC11AQ9Y240 323 aa25.9■■□□□ 1.74
PSPC1-204ENST00000492741 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa25.9■■□□□ 1.74
PSPC1-204ENST00000492741 TNKSO95271 1327 aa25.9■■□□□ 1.74
PSPC1-204ENST00000492741 WDR90Q96KV7 1748 aa25.9■■□□□ 1.74
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PSPC1-204ENST00000492741 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa25.89■■□□□ 1.74
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
PSPC1-204ENST00000492741 TMX3Q96JJ7 454 aa25.89■■□□□ 1.74
PSPC1-204ENST00000492741 TPCN1Q9ULQ1 816 aa25.89■■□□□ 1.74
PSPC1-204ENST00000492741 CCDC69A6NI79 296 aa25.88■■□□□ 1.73
PSPC1-204ENST00000492741 NMT2O60551 498 aa25.88■■□□□ 1.73
PSPC1-204ENST00000492741 CCDC178Q5BJE1 867 aa25.88■■□□□ 1.73
PSPC1-204ENST00000492741 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
PSPC1-204ENST00000492741 TATDN1Q6P1N9 297 aa25.88■■□□□ 1.73
PSPC1-204ENST00000492741 TMTC2Q8N394 836 aa25.88■■□□□ 1.73
PSPC1-204ENST00000492741 NEDD1Q8NHV4 660 aa25.88■■□□□ 1.73
PSPC1-204ENST00000492741 HOOK2Q96ED9 719 aa25.88■■□□□ 1.73
PSPC1-204ENST00000492741 TBC1D12O60347 775 aa25.88■■□□□ 1.73
PSPC1-204ENST00000492741 AKR1B1P15121 316 aa25.88■■□□□ 1.73
PSPC1-204ENST00000492741 LIFRP42702 1097 aa25.88■■□□□ 1.73
PSPC1-204ENST00000492741 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
PSPC1-204ENST00000492741 KRT26Q7Z3Y9 468 aa25.88■■□□□ 1.73
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PSPC1-204ENST00000492741 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
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PSPC1-204ENST00000492741 STK3Q13188 491 aa25.86■■□□□ 1.73
PSPC1-204ENST00000492741 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa25.86■■□□□ 1.73
PSPC1-204ENST00000492741 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa25.86■■□□□ 1.73
PSPC1-204ENST00000492741 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa25.86■■□□□ 1.73
PSPC1-204ENST00000492741 SIPA1L1O43166 1804 aa25.86■■□□□ 1.73
PSPC1-204ENST00000492741 ME3Q16798 604 aa25.85■■□□□ 1.73
PSPC1-204ENST00000492741 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa25.85■■□□□ 1.73
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PSPC1-204ENST00000492741 STX8Q9UNK0 236 aa25.85■■□□□ 1.73
PSPC1-204ENST00000492741 GDF11O95390 407 aa25.85■■□□□ 1.73
PSPC1-204ENST00000492741 SEC23AQ15436 765 aa25.85■■□□□ 1.73
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PSPC1-204ENST00000492741 LARGE1O95461 756 aa25.84■■□□□ 1.73
PSPC1-204ENST00000492741 USP48Q86UV5 1035 aa25.84■■□□□ 1.73
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
PSPC1-204ENST00000492741 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
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PSPC1-204ENST00000492741 MYH8P13535 1937 aa25.84■■□□□ 1.73
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PSPC1-204ENST00000492741 CEP95Q96GE4 821 aa25.83■■□□□ 1.73
PSPC1-204ENST00000492741 MAP3K10Q02779 954 aa25.83■■□□□ 1.72
PSPC1-204ENST00000492741 KAT14Q9H8E8 782 aa25.83■■□□□ 1.72
PSPC1-204ENST00000492741 FOXD4L1Q9NU39 408 aa25.83■■□□□ 1.72
PSPC1-204ENST00000492741 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
PSPC1-204ENST00000492741 GOLGA8BA8MQT2 603 aa25.82■■□□□ 1.72
PSPC1-204ENST00000492741 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
PSPC1-204ENST00000492741 TMEM179Q6ZVK1 233 aa25.82■■□□□ 1.72
PSPC1-204ENST00000492741 NECAB1Q8N987 351 aa25.82■■□□□ 1.72
PSPC1-204ENST00000492741 NMRK2Q9NPI5 230 aa25.82■■□□□ 1.72
PSPC1-204ENST00000492741 GH2P01242 217 aa25.81■■□□□ 1.72
PSPC1-204ENST00000492741 EVCP57679 992 aa25.81■■□□□ 1.72
PSPC1-204ENST00000492741 RAB3GAP1Q15042 981 aa25.81■■□□□ 1.72
PSPC1-204ENST00000492741 APOA5Q6Q788 366 aa25.81■■□□□ 1.72
PSPC1-204ENST00000492741 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.81■■□□□ 1.72
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