RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		20.88	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		20.88	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		20.88	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		20.88	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		20.87	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	ADD2	P35612	726 aa		20.87	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	20.87	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	GPATCH3	Q96I76	525 aa		20.87	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		20.87	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	PTPRF	P10586	1907 aa		20.86	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	20.86	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		20.86	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		20.86	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		20.86	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		20.85	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		20.85	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	HMGCS2	P54868	508 aa		20.85	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	GABPA	Q06546	454 aa		20.85	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	C12orf42	Q96LP6	360 aa		20.85	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	BCL11A	Q9H165	835 aa		20.85	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	20.85	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		20.85	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		20.84	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	20.84	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	CTGF	P29279	349 aa		20.84	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	USP14	P54578	494 aa		20.84	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	20.84	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	IRF5	Q13568	498 aa		20.84	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	20.84	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	TREML2	Q5T2D2	321 aa		20.84	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		20.84	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	CABP5	Q9NP86	173 aa		20.84	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	20.84	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		20.84	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	SWAP70	Q9UH65	585 aa		20.84	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	20.84	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	20.83	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	20.83	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	20.83	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		20.83	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	20.83	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	RAET1E	Q8TD07	263 aa		20.83	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	GCC1	Q96CN9	775 aa		20.83	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	20.83	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	20.83	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	MGAM	O43451	1857 aa		20.83	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	NEFL	P07196	543 aa		20.82	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	GRK4	P32298	578 aa		20.82	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	JAG1	P78504	1218 aa		20.82	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	MTMR2	Q13614	643 aa		20.82	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		20.82	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		20.82	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		20.82	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		20.81	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	MYPN	Q86TC9	1320 aa		20.81	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	GH2	P01242	217 aa		20.81	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	20.81	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	SHMT1	P34896	483 aa		20.81	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	PLCD1	P51178	756 aa		20.81	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		20.81	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		20.81	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	COA7	Q96BR5	231 aa		20.81	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		20.81	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	SIPA1L1	O43166	1804 aa		20.81	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	POTEF	A5A3E0	1075 aa		20.8	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	ERC2	O15083	957 aa		20.8	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	GDF11	O95390	407 aa		20.8	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	20.8	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		20.8	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	TICAM2	Q86XR7	235 aa		20.8	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		20.8	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	LCORL	Q8N3X6	602 aa		20.8	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		20.8	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC17	Q96LX7	622 aa		20.8	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	20.79	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	UBXN2A	P68543	259 aa		20.79	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		20.79	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	20.79	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		20.79	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		20.79	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	20.78	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	MBD4	O95243	580 aa		20.78	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	LBX2	Q6XYB7	198 aa		20.78	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	ARMT1	Q9H993	441 aa		20.78	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	USP17L15	C9J2P7	530 aa		20.77	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		20.77	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	USP17L11	C9JVI0	530 aa		20.77	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	USP17L18	D6R9N7	530 aa		20.77	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	USP17L22	D6RA61	530 aa		20.77	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		20.77	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	USP17L19	D6RCP7	530 aa		20.77	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	USP17L20	D6RJB6	530 aa		20.77	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	HERVK_113	P62684	666 aa		20.77	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	PRKCZ	Q05513	592 aa		20.77	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	USP17L24	Q0WX57	530 aa		20.77	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		20.77	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	C12orf60	Q5U649	245 aa		20.77	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	20.77	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		20.77	■□□□□ 0.92
HDAC10-216	ENST00000489424	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		20.77	■□□□□ 0.92

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms