RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484266.5

CHKB-210, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 1,401 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-210ENST00000484266 C16orf86Q6ZW13 317 aa39.28■■■■□ 3.88
CHKB-210ENST00000484266 ROBO3Q96MS0 1386 aa39.28■■■■□ 3.88
CHKB-210ENST00000484266 IRF6O14896 467 aa39.27■■■■□ 3.88
CHKB-210ENST00000484266 ALX1Q15699 326 aa39.27■■■■□ 3.88
CHKB-210ENST00000484266 RAD50Q92878 1312 aa39.27■■■■□ 3.88
CHKB-210ENST00000484266 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP39.26■■■■□ 3.88
CHKB-210ENST00000484266 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP39.26■■■■□ 3.88
CHKB-210ENST00000484266 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP39.25■■■■□ 3.87
CHKB-210ENST00000484266 CDK8P49336 464 aa39.25■■■■□ 3.87
CHKB-210ENST00000484266 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP39.25■■■■□ 3.87
CHKB-210ENST00000484266 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP39.25■■■■□ 3.87
CHKB-210ENST00000484266 RUFY2Q8WXA3 655 aa39.25■■■■□ 3.87
CHKB-210ENST00000484266 ZHX2Q9Y6X8 837 aa39.25■■■■□ 3.87
CHKB-210ENST00000484266 ASNSP08243 561 aa39.24■■■■□ 3.87
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CHKB-210ENST00000484266 GINM1Q9NU53 330 aa39.24■■■■□ 3.87
CHKB-210ENST00000484266 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa39.24■■■■□ 3.87
CHKB-210ENST00000484266 ZMYM6O95789 1325 aa39.23■■■■□ 3.87
CHKB-210ENST00000484266 WBP1LQ9NX94 342 aa39.23■■■■□ 3.87
CHKB-210ENST00000484266 PTPRFP10586 1907 aa39.23■■■■□ 3.87
CHKB-210ENST00000484266 FGAP02671 866 aa39.23■■■■□ 3.87
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CHKB-210ENST00000484266 SREBF2Q12772 1141 aa39.23■■■■□ 3.87
CHKB-210ENST00000484266 KCNH4Q9UQ05 1017 aa39.23■■■■□ 3.87
CHKB-210ENST00000484266 GH2P01242 217 aa39.22■■■■□ 3.87
CHKB-210ENST00000484266 GTF2A2P52657 109 aa39.22■■■■□ 3.87
CHKB-210ENST00000484266 PPARAQ07869 468 aa39.22■■■■□ 3.87
CHKB-210ENST00000484266 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa39.22■■■■□ 3.87
CHKB-210ENST00000484266 ABCB5Q2M3G0 1257 aa39.21■■■■□ 3.87
CHKB-210ENST00000484266 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP39.2■■■■□ 3.87
CHKB-210ENST00000484266 USP17L5A8MUK1 530 aa39.2■■■■□ 3.87
CHKB-210ENST00000484266 STK11IPQ8N1F8 1099 aa39.2■■■■□ 3.87
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CHKB-210ENST00000484266 INHBEP58166 350 aa39.19■■■■□ 3.86
CHKB-210ENST00000484266 SNAPC2Q13487 334 aa39.19■■■■□ 3.86
CHKB-210ENST00000484266 DSCC1Q9BVC3 393 aa39.19■■■■□ 3.86
CHKB-210ENST00000484266 TBC1D2Q9BYX2 928 aa39.18■■■■□ 3.86
CHKB-210ENST00000484266 CXCL11O14625 94 aa39.17■■■■□ 3.86
CHKB-210ENST00000484266 BRI3BPQ8WY22 251 aa39.17■■■■□ 3.86
CHKB-210ENST00000484266 LAMA4Q16363 1823 aa39.17■■■■□ 3.86
CHKB-210ENST00000484266 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa39.16■■■■□ 3.86
CHKB-210ENST00000484266 CCL15Q16663 113 aa39.16■■■■□ 3.86
CHKB-210ENST00000484266 CABP5Q9NP86 173 aa39.16■■■■□ 3.86
CHKB-210ENST00000484266 ANAPC4Q9UJX5 808 aa39.16■■■■□ 3.86
CHKB-210ENST00000484266 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP39.15■■■■□ 3.86
CHKB-210ENST00000484266 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP39.15■■■■□ 3.86
CHKB-210ENST00000484266 CETPP11597 493 aa39.15■■■■□ 3.86
CHKB-210ENST00000484266 AKR1B1P15121 316 aa39.15■■■■□ 3.86
CHKB-210ENST00000484266 GUCY1A2P33402 732 aa39.15■■■■□ 3.86
CHKB-210ENST00000484266 ZNF280CQ8ND82 737 aa39.15■■■■□ 3.86
CHKB-210ENST00000484266 CCDC17Q96LX7 622 aa39.15■■■■□ 3.86
CHKB-210ENST00000484266 PTPN18Q99952 460 aa39.15■■■■□ 3.86
CHKB-210ENST00000484266 TRIM75PA6NK02 468 aa39.14■■■■□ 3.86
CHKB-210ENST00000484266 CTDSPL2Q05D32 466 aa39.14■■■■□ 3.86
CHKB-210ENST00000484266 IFNL1Q8IU54 200 aa39.14■■■■□ 3.86
CHKB-210ENST00000484266 WDR18Q9BV38 432 aa39.14■■■■□ 3.86
CHKB-210ENST00000484266 AS3MTQ9HBK9 375 aa39.14■■■■□ 3.86
CHKB-210ENST00000484266 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP39.14■■■■□ 3.86
CHKB-210ENST00000484266 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP39.14■■■■□ 3.86
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CHKB-210ENST00000484266 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP39.14■■■■□ 3.86
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CHKB-210ENST00000484266 SPP2Q13103 211 aa39.14■■■■□ 3.86
CHKB-210ENST00000484266 RAB3GAP1Q15042 981 aa39.14■■■■□ 3.86
CHKB-210ENST00000484266 BEGAINQ9BUH8 593 aa39.14■■■■□ 3.86
CHKB-210ENST00000484266 MKNK2Q9HBH9 465 aa39.14■■■■□ 3.86
CHKB-210ENST00000484266 CDC45O75419 566 aa39.13■■■■□ 3.85
CHKB-210ENST00000484266 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa39.13■■■■□ 3.85
CHKB-210ENST00000484266 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP39.12■■■■□ 3.85
CHKB-210ENST00000484266 PDE4BQ07343 736 aa39.12■■■■□ 3.85
CHKB-210ENST00000484266 MOGSQ13724 837 aa39.12■■■■□ 3.85
CHKB-210ENST00000484266 SEPT2Q15019 361 aa39.12■■■■□ 3.85
CHKB-210ENST00000484266 TMEM179Q6ZVK1 233 aa39.12■■■■□ 3.85
CHKB-210ENST00000484266 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP39.12■■■■□ 3.85
CHKB-210ENST00000484266 ZNF287Q9HBT7 754 aa39.12■■■■□ 3.85
CHKB-210ENST00000484266 RNF186Q9NXI6 227 aa39.12■■■■□ 3.85
CHKB-210ENST00000484266 PRDM1O75626 825 aa39.11■■■■□ 3.85
CHKB-210ENST00000484266 HAND2P61296 217 aa39.1■■■■□ 3.85
CHKB-210ENST00000484266 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP39.1■■■■□ 3.85
CHKB-210ENST00000484266 TACC3Q9Y6A5 838 aa39.1■■■■□ 3.85
CHKB-210ENST00000484266 LOC285556D6RIA3 1793 aa39.1■■■■□ 3.85
CHKB-210ENST00000484266 PTH1RQ03431 593 aa39.09■■■■□ 3.85
CHKB-210ENST00000484266 NBPF3Q9H094 633 aa39.08■■■■□ 3.85
CHKB-210ENST00000484266 SAGE1Q9NXZ1 904 aa39.08■■■■□ 3.85
CHKB-210ENST00000484266 CA12O43570 354 aa39.07■■■■□ 3.85
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CHKB-210ENST00000484266 TRPA1O75762 1119 aa39.06■■■■□ 3.84
CHKB-210ENST00000484266 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP39.06■■■■□ 3.84
CHKB-210ENST00000484266 CTNNA3Q9UI47 895 aa39.06■■■■□ 3.84
CHKB-210ENST00000484266 FGRP09769 529 aa39.06■■■■□ 3.84
CHKB-210ENST00000484266 BACE1P56817 501 aa39.06■■■■□ 3.84
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CHKB-210ENST00000484266 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa39.06■■■■□ 3.84
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CHKB-210ENST00000484266 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP39.06■■■■□ 3.84
CHKB-210ENST00000484266 ZNF213O14771 459 aa39.05■■■■□ 3.84
CHKB-210ENST00000484266 ALDH1A1P00352 501 aa39.05■■■■□ 3.84
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