RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479976.5

CHTF18-209, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 2

Gene CHTF18, Length 1,110 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-209ENST00000479976 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP34.54■■■■□ 3.12
CHTF18-209ENST00000479976 LOC285556D6RIA3 1793 aa34.54■■■■□ 3.12
CHTF18-209ENST00000479976 GOLIM4O00461 696 aa34.53■■■■□ 3.12
CHTF18-209ENST00000479976 GDF11O95390 407 aa34.53■■■■□ 3.12
CHTF18-209ENST00000479976 PDE6AP16499 860 aa34.53■■■■□ 3.12
CHTF18-209ENST00000479976 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa34.53■■■■□ 3.12
CHTF18-209ENST00000479976 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa34.52■■■■□ 3.12
CHTF18-209ENST00000479976 MTMR2Q13614 643 aa34.52■■■■□ 3.12
CHTF18-209ENST00000479976 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
CHTF18-209ENST00000479976 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa34.52■■■■□ 3.12
CHTF18-209ENST00000479976 TTC6Q86TZ1 520 aa34.51■■■■□ 3.12
CHTF18-209ENST00000479976 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP34.51■■■■□ 3.12
CHTF18-209ENST00000479976 EHD4Q9H223 541 aa34.51■■■■□ 3.12
CHTF18-209ENST00000479976 SERPINB13Q9UIV8 391 aa34.51■■■■□ 3.12
CHTF18-209ENST00000479976 GABRQQ9UN88 632 aa34.51■■■■□ 3.12
CHTF18-209ENST00000479976 C19orf81C9J6K1 198 aa34.5■■■■□ 3.11
CHTF18-209ENST00000479976 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
CHTF18-209ENST00000479976 FAM110CQ1W6H9 321 aa34.5■■■■□ 3.11
CHTF18-209ENST00000479976 TATDN1Q6P1N9 297 aa34.5■■■■□ 3.11
CHTF18-209ENST00000479976 TMOD4Q9NZQ9 345 aa34.5■■■■□ 3.11
CHTF18-209ENST00000479976 USP17L10C9JJH3 530 aa34.49■■■■□ 3.11
CHTF18-209ENST00000479976 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP34.49■■■■□ 3.11
CHTF18-209ENST00000479976 MTFR1Q15390 333 aa34.49■■■■□ 3.11
CHTF18-209ENST00000479976 ZNF532Q9HCE3 1301 aa34.49■■■■□ 3.11
CHTF18-209ENST00000479976 ATP5JP18859 108 aa34.48■■■■□ 3.11
CHTF18-209ENST00000479976 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP34.48■■■■□ 3.11
CHTF18-209ENST00000479976 LRRCC1Q9C099 1032 aa34.48■■■■□ 3.11
CHTF18-209ENST00000479976 BOLA2Q9H3K6 86 aa34.48■■■■□ 3.11
CHTF18-209ENST00000479976 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa34.47■■■■□ 3.11
CHTF18-209ENST00000479976 FLT3LGP49771 235 aa34.47■■■■□ 3.11
CHTF18-209ENST00000479976 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
CHTF18-209ENST00000479976 PAG1Q9NWQ8 432 aa34.47■■■■□ 3.11
CHTF18-209ENST00000479976 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
CHTF18-209ENST00000479976 GH2P01242 217 aa34.46■■■■□ 3.11
CHTF18-209ENST00000479976 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
CHTF18-209ENST00000479976 SLAIN1Q8ND83 568 aa34.46■■■■□ 3.11
CHTF18-209ENST00000479976 PLCD1P51178 756 aa34.45■■■■□ 3.11
CHTF18-209ENST00000479976 COA7Q96BR5 231 aa34.45■■■■□ 3.11
CHTF18-209ENST00000479976 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP34.44■■■■□ 3.1
CHTF18-209ENST00000479976 UBXN2AP68543 259 aa34.44■■■■□ 3.1
CHTF18-209ENST00000479976 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP34.44■■■■□ 3.1
CHTF18-209ENST00000479976 HAUS7Q99871 368 aa34.44■■■■□ 3.1
CHTF18-209ENST00000479976 ADCY3O60266 1144 aa34.43■■■■□ 3.1
CHTF18-209ENST00000479976 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP34.43■■■■□ 3.1
CHTF18-209ENST00000479976 IRF5Q13568 498 aa34.42■■■■□ 3.1
CHTF18-209ENST00000479976 PXYLP1Q8TE99 480 aa34.42■■■■□ 3.1
CHTF18-209ENST00000479976 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
CHTF18-209ENST00000479976 DOCK3Q8IZD9 2030 aa34.42■■■■□ 3.1
CHTF18-209ENST00000479976 CCL5P13501 91 aa34.41■■■■□ 3.1
CHTF18-209ENST00000479976 LCORLQ8N3X6 602 aa34.41■■■■□ 3.1
CHTF18-209ENST00000479976 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP34.41■■■■□ 3.16e-8■■■■■ 29.5
CHTF18-209ENST00000479976 EMILIN3Q9NT22 766 aa34.41■■■■□ 3.1
CHTF18-209ENST00000479976 MCM9Q9NXL9 1143 aa34.41■■■■□ 3.1
CHTF18-209ENST00000479976 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
CHTF18-209ENST00000479976 SHMT1P34896 483 aa34.4■■■■□ 3.1
CHTF18-209ENST00000479976 ADD2P35612 726 aa34.4■■■■□ 3.1
CHTF18-209ENST00000479976 ABCB5Q2M3G0 1257 aa34.4■■■■□ 3.1
CHTF18-209ENST00000479976 USP17L2Q6R6M4 530 aa34.4■■■■□ 3.1
CHTF18-209ENST00000479976 RNF208Q9H0X6 261 aa34.4■■■■□ 3.1
CHTF18-209ENST00000479976 MORF4L1Q9UBU8 362 aa34.4■■■■□ 3.1
CHTF18-209ENST00000479976 RAB3GAP1Q15042 981 aa34.39■■■■□ 3.1
CHTF18-209ENST00000479976 NKX2-3Q8TAU0 364 aa34.39■■■■□ 3.1
CHTF18-209ENST00000479976 SDR42E1Q8WUS8 393 aa34.39■■■■□ 3.1
CHTF18-209ENST00000479976 CABP5Q9NP86 173 aa34.39■■■■□ 3.1
CHTF18-209ENST00000479976 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
CHTF18-209ENST00000479976 GJB1P08034 283 aa34.38■■■■□ 3.09
CHTF18-209ENST00000479976 ELNP15502 786 aa34.38■■■■□ 3.09
CHTF18-209ENST00000479976 HERVK_113P62684 666 aa34.38■■■■□ 3.09
CHTF18-209ENST00000479976 GABPAQ06546 454 aa34.38■■■■□ 3.09
CHTF18-209ENST00000479976 DCTPP1Q9H773 170 aa34.38■■■■□ 3.09
CHTF18-209ENST00000479976 ARMT1Q9H993 441 aa34.38■■■■□ 3.09
CHTF18-209ENST00000479976 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
CHTF18-209ENST00000479976 SLFNL1Q499Z3 407 aa34.37■■■■□ 3.09
CHTF18-209ENST00000479976 NAV1Q8NEY1 1877 aa34.37■■■■□ 3.09
CHTF18-209ENST00000479976 GJA8P48165 433 aa34.36■■■■□ 3.09
CHTF18-209ENST00000479976 TAOK2Q9UL54 1235 aa34.36■■■■□ 3.09
CHTF18-209ENST00000479976 SHISA4Q96DD7 197 aa34.35■■■■□ 3.09
CHTF18-209ENST00000479976 C12orf42Q96LP6 360 aa34.35■■■■□ 3.09
CHTF18-209ENST00000479976 FEZ1Q99689 392 aa34.35■■■■□ 3.09
CHTF18-209ENST00000479976 MBD4O95243 580 aa34.34■■■■□ 3.09
CHTF18-209ENST00000479976 INHAP05111 366 aa34.34■■■■□ 3.09
CHTF18-209ENST00000479976 USP14P54578 494 aa34.34■■■■□ 3.09
CHTF18-209ENST00000479976 EVX2Q03828 476 aa34.34■■■■□ 3.09
CHTF18-209ENST00000479976 UBE3CQ15386 1083 aa34.34■■■■□ 3.09
CHTF18-209ENST00000479976 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa34.34■■■■□ 3.09
CHTF18-209ENST00000479976 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa34.34■■■■□ 3.09
CHTF18-209ENST00000479976 UNC93B1Q9H1C4 597 aa34.34■■■■□ 3.09
CHTF18-209ENST00000479976 RBPJLQ9UBG7 517 aa34.34■■■■□ 3.09
CHTF18-209ENST00000479976 GJD2Q9UKL4 321 aa34.34■■■■□ 3.09
CHTF18-209ENST00000479976 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
CHTF18-209ENST00000479976 TXNRD2Q9NNW7 524 aa34.33■■■■□ 3.09
CHTF18-209ENST00000479976 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa34.33■■■■□ 3.09
CHTF18-209ENST00000479976 ECHDC1Q9NTX5 307 aa34.33■■■■□ 3.09
CHTF18-209ENST00000479976 PRKAB2O43741 272 aa34.32■■■■□ 3.08
CHTF18-209ENST00000479976 SLC34A2O95436 690 aa34.32■■■■□ 3.08
CHTF18-209ENST00000479976 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa34.32■■■■□ 3.08
CHTF18-209ENST00000479976 ACER1Q8TDN7 264 aa34.32■■■■□ 3.08
CHTF18-209ENST00000479976 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.08
CHTF18-209ENST00000479976 PEX10O60683 326 aa34.31■■■■□ 3.08
CHTF18-209ENST00000479976 GUCY1A2P33402 732 aa34.31■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms