RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-204ENST00000469376 ERO1AQ96HE7 468 aa29.75■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 HSD3B7Q9H2F3 369 aa29.75■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 MYL10Q9BUA6 226 aa29.75■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 ARMT1Q9H993 441 aa29.75■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 KCNH3Q9ULD8 1083 aa29.75■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 MMP1P03956 469 aa29.74■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 PNOCQ13519 176 aa29.74■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 TRIM22Q8IYM9 498 aa29.74■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa29.74■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 TM4SF1P30408 202 aa29.73■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 TMTC2Q8N394 836 aa29.73■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 CNNM3Q8NE01 707 aa29.73■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 CLIC6Q96NY7 704 aa29.73■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 MPHOSPH8Q99549 860 aa29.73■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 RTN1Q16799 776 aa29.72■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 INCENPQ9NQS7 918 aa29.72■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 OGFRQ9NZT2 677 aa29.72■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa29.72■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 UBASH3AP57075 661 aa29.72■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 WTAPQ15007 396 aa29.72■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 SLC10A5Q5PT55 438 aa29.72■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 TACC3Q9Y6A5 838 aa29.72■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 RTL9Q8NET4 1388 aa29.72■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 SLU7O95391 586 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 TDO2P48775 406 aa29.71■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 LONRF3Q496Y0 759 aa29.71■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 RILPL1Q5EBL4 403 aa29.71■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 ISM2Q6H9L7 571 aa29.71■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 NLGN1Q8N2Q7 840 aa29.71■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 ERICH2A1L162 156 aa29.7■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 DEXIO95424 95 aa29.7■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 SERPINC1P01008 464 aa29.7■■■□□ 2.35
OPN3-204ENST00000469376 NPHP1O15259 732 aa29.7■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 ATP1A3P13637 1013 aa29.7■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa29.7■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 SOCS7O14512 581 aa29.69■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 LAMB2P55268 1798 aa29.69■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 PTPREP23469 700 aa29.68■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 DMTNQ08495 405 aa29.68■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 STK11IPQ8N1F8 1099 aa29.68■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 LCORLQ8N3X6 602 aa29.68■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 L2HGDHQ9H9P8 463 aa29.68■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa29.68■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 BTBD18B2RXH4 712 aa29.68■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 CCDC152Q4G0S7 254 aa29.68■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 VSTM4Q8IW00 320 aa29.68■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 SERPINB2P05120 415 aa29.67■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 CNBD1Q8NA66 436 aa29.67■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 CEP131Q9UPN4 1083 aa29.67■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 SPDYE4A6NLX3 237 aa29.66■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 CFAP100Q494V2 611 aa29.66■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP29.66■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 DACH1Q9UI36 760 aa29.66■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 PRKAB2O43741 272 aa29.66■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 GUCY1A2P33402 732 aa29.66■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 DDR1Q08345 913 aa29.66■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 PPP2R5BQ15173 497 aa29.66■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 FCHSD1Q86WN1 690 aa29.66■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 CCDC24Q8N4L8 307 aa29.66■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 TMX1Q9H3N1 280 aa29.66■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 TAOK2Q9UL54 1235 aa29.66■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 UBE2Q2LH0YL09 131 aa29.65■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 NT5DC1Q5TFE4 455 aa29.65■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 PKNOX2Q96KN3 472 aa29.65■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 PRDM10Q9NQV6 1147 aa29.65■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 C3orf67Q6ZVT6 689 aa29.64■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 DPF2Q92785 391 aa29.64■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 SEC31BQ9NQW1 1179 aa29.64■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 TOMM22Q9NS69 142 aa29.64■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 PRDM4Q9UKN5 801 aa29.64■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 QSER1Q2KHR3 1735 aa29.64■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 POSTNQ15063 836 aa29.64■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 PRR5LQ6MZQ0 368 aa29.64■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 KANK3Q6NY19 840 aa29.64■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 TRIML1Q8N9V2 468 aa29.64■■■□□ 2.34
OPN3-204ENST00000469376 NLRP3Q96P20 1036 aa29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms