RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461448.5

SNHG12-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG12, Length 1,629 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12-201ENST00000461448 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
SNHG12-201ENST00000461448 CAP2P40123 477 aa23.15■■□□□ 1.3
SNHG12-201ENST00000461448 HUNKP57058 714 aa23.15■■□□□ 1.3
SNHG12-201ENST00000461448 TSGA10IPQ3SY00 556 aa23.15■■□□□ 1.3
SNHG12-201ENST00000461448 KCNB2Q92953 911 aa23.15■■□□□ 1.3
SNHG12-201ENST00000461448 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP23.15■■□□□ 1.3
SNHG12-201ENST00000461448 TAF6LQ9Y6J9 622 aa23.15■■□□□ 1.3
SNHG12-201ENST00000461448 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 RASA1P20936 1047 aa23.14■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 TRDNQ13061 729 aa23.14■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 LDLRAD1Q5T700 205 aa23.14■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 CNNM2Q9H8M5 875 aa23.14■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 LAMA4Q16363 1823 aa23.14■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 RBM25P49756 843 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 VGLL4Q14135 290 aa23.13■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 ABCB5Q2M3G0 1257 aa23.13■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 CLMNQ96JQ2 1002 aa23.13■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 CCDC17Q96LX7 622 aa23.13■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 CABP5Q9NP86 173 aa23.13■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 E7EWF7 191 aa23.12■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 ORC4O43929 436 aa23.12■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 FGRP09769 529 aa23.12■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 AKR1B1P15121 316 aa23.12■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 C1QTNF8P60827 252 aa23.12■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 SAPCD2Q86UD0 394 aa23.12■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 SCYL3Q8IZE3 742 aa23.12■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 ELP3Q9H9T3 547 aa23.12■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 PICK1Q9NRD5 415 aa23.12■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 TLL2Q9Y6L7 1015 aa23.12■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 NEDD4P46934 1319 aa23.12■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 GH2P01242 217 aa23.11■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 JAG1P78504 1218 aa23.11■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 FAM47AQ5JRC9 791 aa23.11■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 SLC10A4Q96EP9 437 aa23.11■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 KRT23Q9C075 422 aa23.11■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 PSMA5P28066 241 aa23.11■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 TFAP4Q01664 338 aa23.11■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 RASEFQ8IZ41 740 aa23.11■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.11■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 CREBZFQ9NS37 354 aa23.11■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 SNX14Q9Y5W7 946 aa23.11■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa23.11■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 UNCXA6NJT0 531 aa23.1■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 TSPY2A6NKD2 308 aa23.1■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 TSPY3P0CV98 308 aa23.1■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 TSPY8P0CW00 308 aa23.1■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 STOX1Q6ZVD7 989 aa23.1■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 NCOA7Q8NI08 942 aa23.1■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa23.1■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 B4E1Z4 1266 aa23.09■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 ASNSP08243 561 aa23.09■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 RAB3GAP1Q15042 981 aa23.09■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 ESR2Q92731 530 aa23.09■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 GINM1Q9NU53 330 aa23.08■■□□□ 1.29
SNHG12-201ENST00000461448 KDM4AO75164 1064 aa23.08■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 SEPT2Q15019 361 aa23.08■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 TMEM179Q6ZVK1 233 aa23.08■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 IL27Q8NEV9 243 aa23.08■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 IL17RAQ96F46 866 aa23.08■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 NEK1Q96PY6 1258 aa23.08■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 PTPRAP18433 802 aa23.07■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 RGMBQ6NW40 437 aa23.07■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 NEDD1Q8NHV4 660 aa23.07■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 NKX2-3Q8TAU0 364 aa23.07■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 TM6SF1Q9BZW5 370 aa23.07■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 USP17L5A8MUK1 530 aa23.06■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 GUCY1A2P33402 732 aa23.06■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.06■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 ZHX2Q9Y6X8 837 aa23.06■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 OTOFQ9HC10 1997 aa23.06■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 HTRA3P83110 453 aa23.05■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 ERO1BQ86YB8 467 aa23.05■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 OPTNQ96CV9 577 aa23.05■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 OTUD5Q96G74 571 aa23.05■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 ZSWIM5Q9P217 1185 aa23.05■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 SPDYE5A6NIY4 337 aa23.04■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 HSPA6P17066 643 aa23.04■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 DEFB115Q30KQ5 88 aa23.04■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 ADCK5Q3MIX3 580 aa23.04■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 CLEC10AQ8IUN9 316 aa23.04■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 MYH8P13535 1937 aa23.04■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 ATP2B2Q01814 1243 aa23.04■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa23.04■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 CYB5R4Q7L1T6 521 aa23.04■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 HHIPL1Q96JK4 782 aa23.04■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa23.04■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 KANSL2Q9H9L4 492 aa23.04■■□□□ 1.28
SNHG12-201ENST00000461448 AS3MTQ9HBK9 375 aa23.04■■□□□ 1.28
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