RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455580.5

PPP1CB-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, human

TSL 3

Gene PPP1CB, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PPP1CB-208	ENST00000455580	POTEF	A5A3E0	1075 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PPP1CB-208	ENST00000455580	ADD2	P35612	726 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PPP1CB-208	ENST00000455580	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
PPP1CB-208	ENST00000455580	CENPF	P49454	3210 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PPP1CB-208	ENST00000455580	MYH1	P12882	1939 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PPP1CB-208	ENST00000455580	PLCD1	P51178	756 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PPP1CB-208	ENST00000455580	FCGRT	P55899	365 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PPP1CB-208	ENST00000455580	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	29.05	■■■□□ 2.24	7e-17	■■□□□ 12.1
PPP1CB-208	ENST00000455580	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PPP1CB-208	ENST00000455580	C19orf81	C9J6K1	198 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PPP1CB-208	ENST00000455580	MTMR2	Q13614	643 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PPP1CB-208	ENST00000455580	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PPP1CB-208	ENST00000455580	LCORL	Q8N3X6	602 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PPP1CB-208	ENST00000455580	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	29.04	■■■□□ 2.24
PPP1CB-208	ENST00000455580	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PPP1CB-208	ENST00000455580	USP17L10	C9JJH3	530 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PPP1CB-208	ENST00000455580	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
PPP1CB-208	ENST00000455580	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PPP1CB-208	ENST00000455580	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PPP1CB-208	ENST00000455580	GH2	P01242	217 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PPP1CB-208	ENST00000455580	UBE3C	Q15386	1083 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PPP1CB-208	ENST00000455580	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PPP1CB-208	ENST00000455580	ARMT1	Q9H993	441 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PPP1CB-208	ENST00000455580	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	29.02	■■■□□ 2.24
PPP1CB-208	ENST00000455580	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PPP1CB-208	ENST00000455580	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PPP1CB-208	ENST00000455580	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	29.02	■■■□□ 2.24
PPP1CB-208	ENST00000455580	MYPN	Q86TC9	1320 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PPP1CB-208	ENST00000455580	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.23
PPP1CB-208	ENST00000455580	GABPA	Q06546	454 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PPP1CB-208	ENST00000455580	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.23
PPP1CB-208	ENST00000455580	RAET1E	Q8TD07	263 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PPP1CB-208	ENST00000455580	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PPP1CB-208	ENST00000455580	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.23
PPP1CB-208	ENST00000455580	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PPP1CB-208	ENST00000455580	SHMT1	P34896	483 aa		29	■■■□□ 2.23
PPP1CB-208	ENST00000455580	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	29	■■■□□ 2.23
PPP1CB-208	ENST00000455580	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		29	■■■□□ 2.23
PPP1CB-208	ENST00000455580	CHGB	P05060	677 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PPP1CB-208	ENST00000455580	PRKCZ	Q05513	592 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PPP1CB-208	ENST00000455580	PRKAB2	O43741	272 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PPP1CB-208	ENST00000455580	MBD4	O95243	580 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PPP1CB-208	ENST00000455580	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	28.98	■■■□□ 2.23
PPP1CB-208	ENST00000455580	GRK4	P32298	578 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PPP1CB-208	ENST00000455580	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PPP1CB-208	ENST00000455580	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
PPP1CB-208	ENST00000455580	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PPP1CB-208	ENST00000455580	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PPP1CB-208	ENST00000455580	GABRQ	Q9UN88	632 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PPP1CB-208	ENST00000455580	EVX2	Q03828	476 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PPP1CB-208	ENST00000455580	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PPP1CB-208	ENST00000455580	CABP5	Q9NP86	173 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PPP1CB-208	ENST00000455580	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	28.96	■■■□□ 2.23
PPP1CB-208	ENST00000455580	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PPP1CB-208	ENST00000455580	GPATCH3	Q96I76	525 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PPP1CB-208	ENST00000455580	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	28.96	■■■□□ 2.23
PPP1CB-208	ENST00000455580	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	28.96	■■■□□ 2.23
PPP1CB-208	ENST00000455580	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.23
PPP1CB-208	ENST00000455580	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	28.95	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	28.95	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	MGAM	O43451	1857 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	CYP2D6	P10635	497 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	GUCY1A2	P33402	732 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	FLT3LG	P49771	235 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	CRBN	Q96SW2	442 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	COA7	Q96BR5	231 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	C12orf42	Q96LP6	360 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	BRCA2	P51587	3418 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	MTFR1	Q15390	333 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	USP14	P54578	494 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	HERVK_113	P62684	666 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	IRF5	Q13568	498 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	C12orf60	Q5U649	245 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	ACER1	Q8TDN7	264 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	SWAP70	Q9UH65	585 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	ADCY3	O60266	1144 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	SEPT2	Q15019	361 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	FEZ1	Q99689	392 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	USP17L12	C9JPN9	530 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	USP17L21	D6R901	530 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	UBXN2A	P68543	259 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PPP1CB-208	ENST00000455580	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		28.89	■■■□□ 2.22

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