RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa31.87■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADCY3O60266 1144 aa31.86■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GDF11O95390 407 aa31.86■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BACE1P56817 501 aa31.86■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NKX2-3Q8TAU0 364 aa31.86■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COA7Q96BR5 231 aa31.86■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMOD4Q9NZQ9 345 aa31.86■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP31.85■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF208Q9H0X6 261 aa31.85■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RCAN3Q9UKA8 241 aa31.85■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa31.85■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GJB1P08034 283 aa31.84■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IRF5Q13568 498 aa31.84■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP31.84■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SIRT2Q8IXJ6 389 aa31.84■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SHISA4Q96DD7 197 aa31.84■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP31.84■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYH1P12882 1939 aa31.84■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C19orf81C9J6K1 198 aa31.83■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PXYLP1Q8TE99 480 aa31.83■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP17L10C9JJH3 530 aa31.82■■■□□ 2.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP31.82■■■□□ 2.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ELNP15502 786 aa31.82■■■□□ 2.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GJA8P48165 433 aa31.82■■■□□ 2.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB11FIP3O75154 756 aa31.81■■■□□ 2.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAOK2Q9UL54 1235 aa31.81■■■□□ 2.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP31.8■■■□□ 2.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTC6Q86TZ1 520 aa31.8■■■□□ 2.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP31.8■■■□□ 2.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BCL11AQ9H165 835 aa31.8■■■□□ 2.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UNC93B1Q9H1C4 597 aa31.8■■■□□ 2.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EHD4Q9H223 541 aa31.8■■■□□ 2.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SERPINB13Q9UIV8 391 aa31.8■■■□□ 2.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INHAP05111 366 aa31.79■■■□□ 2.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa31.79■■■□□ 2.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TATDN1Q6P1N9 297 aa31.79■■■□□ 2.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa31.78■■■□□ 2.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GH2P01242 217 aa31.78■■■□□ 2.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDE6AP16499 860 aa31.78■■■□□ 2.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MORF4L1Q9UBU8 362 aa31.78■■■□□ 2.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GOLIM4O00461 696 aa31.77■■■□□ 2.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DOCK3Q8IZD9 2030 aa31.76■■■□□ 2.68
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HERVK_113P62684 666 aa31.75■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP17L2Q6R6M4 530 aa31.75■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF532Q9HCE3 1301 aa31.75■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP31.74■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EMILIN3Q9NT22 766 aa31.74■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SGPL1O95470 568 aa31.73■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP31.73■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLCD1P51178 756 aa31.73■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDE3AQ14432 1141 aa31.72■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABCB5Q2M3G0 1257 aa31.72■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa31.72■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa31.72■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FEZ1Q99689 392 aa31.72■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GJD2Q9UKL4 321 aa31.72■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NAV1Q8NEY1 1877 aa31.72■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa31.71■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB3GAP1Q15042 981 aa31.71■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CABP5Q9NP86 173 aa31.71■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PAG1Q9NWQ8 432 aa31.71■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SHMT1P34896 483 aa31.7■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP31.7■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C20orf194Q5TEA3 1177 aa31.7■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DEFB118Q96PH6 123 aa31.7■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BOLA2Q9H3K6 86 aa31.7■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TXNRD2Q9NNW7 524 aa31.7■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MCM9Q9NXL9 1143 aa31.7■■■□□ 2.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CEP290O15078 2479 aa31.69■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PEX10O60683 326 aa31.69■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP31.69■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAPN2P17655 700 aa31.69■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP5JP18859 108 aa31.69■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DPF3Q92784 378 aa31.69■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C12orf42Q96LP6 360 aa31.69■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HTATIP2Q9BUP3 242 aa31.69■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP31.69■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBPJLQ9UBG7 517 aa31.69■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H0YGN5 161 aa31.68■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TFRCP02786 760 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HMGCRP04035 888 aa31.68■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP14P54578 494 aa31.68■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LCORLQ8N3X6 602 aa31.68■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SDR42E1Q8WUS8 393 aa31.67■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PAGR1Q9BTK6 254 aa31.67■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa31.67■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP17L15C9J2P7 530 aa31.66■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP17L13C9JLJ4 530 aa31.66■■■□□ 2.66
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP17L11C9JVI0 530 aa31.66■■■□□ 2.66
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