RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399336.8

NOMO3-202, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOMO3, Length 4,356 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-202ENST00000399336 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa20.7■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 EEF2KMTQ96G04 330 aa20.7■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 ARID5BQ14865 1188 aa20.69■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa20.69■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 KRBA2Q6ZNG9 492 aa20.69■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 CEP112Q8N8E3 955 aa20.69■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 TAF6LQ9Y6J9 622 aa20.69■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa20.69■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 OVOS2Q6IE36 1432 aa20.69■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 UBAP1LF5GYI3 381 aa20.69■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 GOLGA8FQ08AF8 430 aa20.69■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa20.69■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 CCDC122Q5T0U0 273 aa20.69■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 GPCPD1Q9NPB8 672 aa20.69■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 PDE4DQ08499 809 aa20.69■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 NR5A1Q13285 461 aa20.69■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 HLFQ16534 295 aa20.69■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 UFL1O94874 794 aa20.68■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 TXKP42681 527 aa20.68■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 INCENPQ9NQS7 918 aa20.68■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 POLR3EQ9NVU0 708 aa20.68■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 ZSWIM5Q9P217 1185 aa20.68■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 DDIT3P35638 169 aa20.68■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 SSR1P43307 286 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 CNBD1Q8NA66 436 aa20.68■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 TTLL11Q8NHH1 800 aa20.68■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 MACROD2A1Z1Q3 448 aa20.67■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 KRT83P78385 493 aa20.67■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 PAK1Q13153 545 aa20.67■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa20.67■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP20.67■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 PIK3C2BO00750 1634 aa20.67■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 MCAMP43121 646 aa20.67■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa20.67■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 COBLO75128 1261 aa20.67■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa20.66■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 SIK1P57059 783 aa20.66■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 NBPF26B4DH59 902 aa20.66■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 TACC1O75410 805 aa20.66■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 NBPF14Q5TI25 921 aa20.66■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa20.66■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 NBPF15Q8N660 670 aa20.66■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 LRRC27Q9C0I9 530 aa20.66■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 ATG3Q9NT62 314 aa20.66■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa20.66■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 PPP2R5BQ15173 497 aa20.66■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.66■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 FERMT2Q96AC1 680 aa20.66■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 SAMM50Q9Y512 469 aa20.66■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 BICDL2A1A5D9 508 aa20.65■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 TBCAO75347 108 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 PLCG2P16885 1265 aa20.65■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 GPATCH11Q8N954 259 aa20.65■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 SLF1Q9BQI6 1058 aa20.65■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 ETF1P62495 437 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 MED23Q9ULK4 1368 aa20.65■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 TOM1O60784 492 aa20.65■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 NRKQ7Z2Y5 1582 aa20.65■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 SYCP3Q8IZU3 236 aa20.64■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 LCORLQ8N3X6 602 aa20.64■□□□□ 0.9
NOMO3-202ENST00000399336 PLCD1P51178 756 aa20.64■□□□□ 0.89
NOMO3-202ENST00000399336 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
NOMO3-202ENST00000399336 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
NOMO3-202ENST00000399336 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
NOMO3-202ENST00000399336 STOX1Q6ZVD7 989 aa20.64■□□□□ 0.89
NOMO3-202ENST00000399336 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.64■□□□□ 0.89
NOMO3-202ENST00000399336 ATP1A3P13637 1013 aa20.64■□□□□ 0.89
NOMO3-202ENST00000399336 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
NOMO3-202ENST00000399336 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa20.63■□□□□ 0.89
NOMO3-202ENST00000399336 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
NOMO3-202ENST00000399336 RASGRF1Q13972 1273 aa20.63■□□□□ 0.89
NOMO3-202ENST00000399336 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
NOMO3-202ENST00000399336 TRAF5O00463 557 aa20.63■□□□□ 0.89
NOMO3-202ENST00000399336 PTGDRQ13258 359 aa20.63■□□□□ 0.89
NOMO3-202ENST00000399336 SCARF1Q14162 830 aa20.63■□□□□ 0.89
NOMO3-202ENST00000399336 TNIP1Q15025 636 aa20.63■□□□□ 0.89
NOMO3-202ENST00000399336 DYMQ7RTS9 669 aa20.63■□□□□ 0.89
NOMO3-202ENST00000399336 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
NOMO3-202ENST00000399336 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
NOMO3-202ENST00000399336 CHMP4BP1P59074 171 aa20.63■□□□□ 0.89
NOMO3-202ENST00000399336 WDR66Q8TBY9 1149 aa20.63■□□□□ 0.89
NOMO3-202ENST00000399336 NELFBQ8WX92 580 aa20.63■□□□□ 0.89
NOMO3-202ENST00000399336 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
NOMO3-202ENST00000399336 GOPCQ9HD26 462 aa20.63■□□□□ 0.89
NOMO3-202ENST00000399336 VPS18Q9P253 973 aa20.63■□□□□ 0.89
NOMO3-202ENST00000399336 SV2BQ7L1I2 683 aa20.62■□□□□ 0.89
NOMO3-202ENST00000399336 GOLGA8HP0CJ92 632 aa20.62■□□□□ 0.89
NOMO3-202ENST00000399336 ERMNQ8TAM6 284 aa20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.9 ms