RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 PLCB4Q15147 1175 aa10.72□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 POGZQ7Z3K3 1410 aa10.72□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 USHBP1Q8N6Y0 703 aa10.72□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 LRRC7Q96NW7 1537 aa10.72□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 HOMER3Q9NSC5 361 aa10.72□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 FAM184BQ9ULE4 1060 aa10.72□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF232Q9UNY5 417 aa10.72□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 MAST1Q9Y2H9 1570 aa10.72□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 PTGISQ16647 500 aa10.72□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 SPATA21Q7Z572 469 aa10.72□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 KIAA0825Q8IV33 1275 aa10.72□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 CUL5Q93034 780 aa10.72□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 C8orf76Q96K31 380 aa10.72□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 NEK1Q96PY6 1258 aa10.72□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 GJB4Q9NTQ9 266 aa10.72□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 MYO1AQ9UBC5 1043 aa10.72□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 SAR1BQ9Y6B6 198 aa10.72□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 A0A0D9SFI3 127 aa10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 CDC27P30260 824 aa10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 SCTRP47872 440 aa10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 CHST3Q7LGC8 479 aa10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 LINC00301Q8NCQ3 95 aa10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 HDAC7Q8WUI4 952 aa10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 CYFIP2Q96F07 1278 aa10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 PSMB7Q99436 277 aa10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 OSBPL7Q9BZF2 842 aa10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 C19orf44Q9H6X5 657 aa10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 C15orf41Q9Y2V0 281 aa10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 NR1D1P20393 614 aa10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 MXRA7P84157 204 aa10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 MAATS1Q7Z4T9 603 aa10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 EHBP1Q8NDI1 1231 aa10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 KCNV2Q8TDN2 545 aa10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 MAP4K1Q92918 833 aa10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 BOLA2Q9H3K6 86 aa10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-203ENST00000395211 NPM3O75607 178 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 CDKL5O76039 1030 aa10.71□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 AMPHP49418 695 aa10.71□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 KCNG4Q8TDN1 519 aa10.71□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 OSBPL9Q96SU4 736 aa10.71□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 RMI1Q9H9A7 625 aa10.71□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 RGL1Q9NZL6 768 aa10.71□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 TSPYL4Q9UJ04 414 aa10.71□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa10.71□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 SPDYE3A6NKU9 549 aa10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 FOXN1O15353 648 aa10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 ATP5JP18859 108 aa10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 POLE2P56282 527 aa10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 IFFO1Q0D2I5 559 aa10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 MTA1Q13330 715 aa10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 ODF2Q5BJF6 829 aa10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 CFAP58Q5T655 872 aa10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 MFSD4BQ5TF39 518 aa10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 HVCN1Q96D96 273 aa10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 GPATCH3Q96I76 525 aa10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 ZIM3Q96PE6 472 aa10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 KDM4CQ9H3R0 1056 aa10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 ARHGAP5Q13017 1502 aa10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 A0A1W2PQ27 194 aa10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 A0A1W2PQ64 194 aa10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 A0A1W2PQD8 194 aa10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 COBLO75128 1261 aa10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 PPARAQ07869 468 aa10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 JAKMIP2Q96AA8 810 aa10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 CDC25AP30304 524 aa10.69□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 SKOR1P84550 965 aa10.69□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP10.69□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 FLIIQ13045 1269 aa10.69□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 AACSQ86V21 672 aa10.69□□□□□ -0.7
TMOD1-203ENST00000395211 SYCP3Q8IZU3 236 aa10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms