RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 SLFN12Q8IYM2 578 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 KCT2Q8NC54 265 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 FAM13CQ8NE31 585 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 WFDC12Q8WWY7 111 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 MKL1Q969V6 931 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 TNKS2Q9H2K2 1166 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 PIF1Q9H611 641 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 A0A1W2PQH9 124 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 SART1O43290 800 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
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PTPRC-205ENST00000391970 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 ACRP10323 421 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 GLB1P16278 677 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 IREB2P48200 963 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
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PTPRC-205ENST00000391970 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 PPP2R5EQ16537 467 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 DDR2Q16832 855 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 CDC37L1Q7L3B6 337 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 SLC9A7Q96T83 725 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRC-205ENST00000391970 UPK3BL1B0FP48 263 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 UPK3BL2E5RIL1 263 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 CST3P01034 146 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 RAG1P15918 1043 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 RAB6AP20340 208 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 RASA3Q14644 834 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 NFE2L2Q16236 605 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 FXNQ16595 210 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 UVSSAQ2YD98 709 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 CDPF1Q6NVV7 123 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 GIMAP6Q6P9H5 292 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 TXNRD3Q86VQ6 643 aa4.74□□□□□ -1.65
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PTPRC-205ENST00000391970 MEGF10Q96KG7 1140 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 MSRB2Q9Y3D2 182 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 SLC12A7Q9Y666 1083 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 LRIG2O94898 1065 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 CCNFP41002 786 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 GSK3AP49840 483 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 USP11P51784 963 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRC-205ENST00000391970 UNC5AQ6ZN44 842 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 ARMCX6Q7L4S7 300 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 LRP10Q7Z4F1 713 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRC-205ENST00000391970 PHACTR4Q8IZ21 702 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 MYRFLQ96LU7 910 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 YIPF2Q9BWQ6 316 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 FOXQ1Q9C009 403 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRC-205ENST00000391970 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
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PTPRC-205ENST00000391970 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRC-205ENST00000391970 CHRNA4P43681 627 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-205ENST00000391970 ARMC10Q8N2F6 343 aa4.72□□□□□ -1.65
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PTPRC-205ENST00000391970 DEPDC7Q96QD5 511 aa4.72□□□□□ -1.65
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PTPRC-205ENST00000391970 ST7Q9NRC1 585 aa4.72□□□□□ -1.65
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PTPRC-205ENST00000391970 KRBA1A5PL33 1030 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 FAM221BA6H8Z2 402 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 FAM86C2PA6NEL3 165 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 B2RBV5 119 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 UBOX5O94941 541 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 GJB6O95452 261 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-205ENST00000391970 NFICP08651 508 aa4.71□□□□□ -1.66
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