RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373162.5

TRAPPC3-202, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,056 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-202ENST00000373162 OSBPP22059 807 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 PSMC4P43686 418 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 USP5P45974 858 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 PLCD1P51178 756 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 HMGCS2P54868 508 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 SRRDQ9UH36 339 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 SERPINB13Q9UIV8 391 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 GDF11O95390 407 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 SHMT1P34896 483 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 BACE1P56817 501 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 KIF22Q14807 665 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 AS3MTQ9HBK9 375 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 MTMR2Q13614 643 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 UBE3CQ15386 1083 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 TTC6Q86TZ1 520 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 ECHDC1Q9NTX5 307 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 GUCY1A2P33402 732 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 FAM110CQ1W6H9 321 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 SDR42E1Q8WUS8 393 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC3-202ENST00000373162 SALL3Q9BXA9 1300 aa21.77■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 DOCK3Q8IZD9 2030 aa21.77■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 PLXNB2O15031 1838 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 GH2P01242 217 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 POTEEQ6S8J3 1075 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 C12orf42Q96LP6 360 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 ARMT1Q9H993 441 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 PNMA3Q9UL41 463 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 C19orf81C9J6K1 198 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 PRKAB2O43741 272 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 MBD4O95243 580 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 PRKCZQ05513 592 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 SH3TC2Q8TF17 1288 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 EMILIN3Q9NT22 766 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 MORF4L1Q9UBU8 362 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 GABRQQ9UN88 632 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 MYPNQ86TC9 1320 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 USP17L10C9JJH3 530 aa21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 CYP2D6P10635 497 aa21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 FCGRTP55899 365 aa21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 CRBNQ96SW2 442 aa21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 SMIM22K7EJ46 135 aa21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.072e-6■□□□□ 10.8
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TRAPPC3-202ENST00000373162 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 KBTBD3Q8NAB2 608 aa21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 PI4K2BQ8TCG2 481 aa21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 TRIM34Q9BYJ4 488 aa21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 MCM9Q9NXL9 1143 aa21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 MYH8P13535 1937 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 HOXD10P28358 340 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 BCL11AQ9H165 835 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 RLFQ13129 1914 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 EN2P19622 333 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 IRF5Q13568 498 aa21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 ABCB5Q2M3G0 1257 aa21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
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TRAPPC3-202ENST00000373162 SLC44A5Q8NCS7 719 aa21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 TTC41PQ6P2S7 1318 aa21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 A0A0G2JMZ2 1700 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
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TRAPPC3-202ENST00000373162 C12orf60Q5U649 245 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 USP17L2Q6R6M4 530 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 ACER1Q8TDN7 264 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 TXNRD2Q9NNW7 524 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 FLT3LGP49771 235 aa21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 HERVK_113P62684 666 aa21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 MTFR1Q15390 333 aa21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 SHISA4Q96DD7 197 aa21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 DYNLL2Q96FJ2 89 aa21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 TMOD4Q9NZQ9 345 aa21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 A0A1W2PRG0 241 aa21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 SEPT2Q15019 361 aa21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 SIAH1Q8IUQ4 282 aa21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 OSBP2Q969R2 916 aa21.68■■□□□ 1.06
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