RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 PDGFAP04085 211 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF20P17024 532 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 FGD1P98174 961 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 SFRP5Q5T4F7 317 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 CAPN12Q6ZSI9 719 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 FERMT3Q86UX7 667 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF575Q86XF7 245 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEFF1Q8IYR6 380 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 OXR1Q8N573 874 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 SNX29Q8TEQ0 813 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 TCF12Q99081 682 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 PCED1AQ9H1Q7 454 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 VRTNQ9H8Y1 702 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 LIN7BQ9HAP6 207 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRT82Q9NSB4 513 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 SIRT5Q9NXA8 310 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR14I1A6ND48 311 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 HRKO00198 91 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 ERVK-24P63145 666 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 OCLNQ16625 522 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 CRIP3Q6Q6R5 217 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM129CQ86XR2 697 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 POM121Q96HA1 1249 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 USP40Q9NVE5 1235 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 C11orf21Q9P2W6 132 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPR160Q9UJ42 338 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 ITGB3P05106 788 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZGLP1P0C6A0 271 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLURP1P55000 103 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 SNX17Q15036 470 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 NR0B2Q15466 257 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 PWWP2AQ96N64 755 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 CNTD2Q9H8S5 307 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLITRK5O94991 958 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 ITPKAP23677 461 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 ADGRF1Q5T601 910 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARMCX6Q7L4S7 300 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPRED1Q7Z699 444 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 UBE3DQ7Z6J8 389 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 CREG2Q8IUH2 290 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 TTC9BQ8N6N2 239 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 MZB1Q8WU39 189 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 C8orf49Q96NF6 230 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 FFAR3O14843 346 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 RAD21O60216 631 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 LRIG2O94898 1065 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 CBX7O95931 251 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 VIPR1P32241 457 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 NTF4P34130 210 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 GALK1P51570 392 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDR1P51861 262 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRTAP10-9P60411 292 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 KLF10Q13118 480 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 NT5DC1Q5TFE4 455 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDC37L1Q7L3B6 337 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPPL2CQ8IUH8 684 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 KCNB2Q92953 911 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 LOXL4Q96JB6 756 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-170P-201ENST00000362832 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-170P-201ENST00000362832 CNR2P34972 360 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLCB3Q01970 1234 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-170P-201ENST00000362832 TNK2Q07912 1038 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-170P-201ENST00000362832 EHHADHQ08426 723 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPM1JQ5JR12 505 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-170P-201ENST00000362832 SHISA4Q96DD7 197 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-170P-201ENST00000362832 SAMD11Q96NU1 681 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF747Q9BV97 191 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-170P-201ENST00000362832 VPS11Q9H270 941 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-170P-201ENST00000362832 PICK1Q9NRD5 415 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-170P-201ENST00000362832 WASH4PA8MWX3 477 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-170P-201ENST00000362832 LMO1P25800 156 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-170P-201ENST00000362832 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-170P-201ENST00000362832 KIR3DL1P43629 444 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-170P-201ENST00000362832 INHBEP58166 350 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-170P-201ENST00000362832 CAP1Q01518 475 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-170P-201ENST00000362832 CHRNEQ04844 493 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-170P-201ENST00000362832 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms