RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CCL20-201ENST00000358813 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa7.59□□□□□ -1.19
CCL20-201ENST00000358813 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CCL20-201ENST00000358813 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CCL20-201ENST00000358813 MED14O60244 1454 aa7.59□□□□□ -1.19
CCL20-201ENST00000358813 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CCL20-201ENST00000358813 MSH6P52701 1360 aa7.59□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa7.58□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 A0A1W2PP55 124 aa7.58□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 DNAJC6O75061 913 aa7.58□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 CABP4P57796 275 aa7.58□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa7.58□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 GPAT2Q6NUI2 795 aa7.58□□□□□ -1.2
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CCL20-201ENST00000358813 FAM117BQ6P1L5 589 aa7.58□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 TXNDC11Q6PKC3 985 aa7.58□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa7.58□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 GLIS3Q8NEA6 775 aa7.58□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 DEPDC7Q96QD5 511 aa7.58□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 ADAM19Q9H013 955 aa7.58□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 KCNQ5Q9NR82 932 aa7.58□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 SNTG2Q9NY99 539 aa7.58□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 PRKAG3Q9UGI9 489 aa7.58□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa7.58□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 KANK1Q14678 1352 aa7.58□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa7.57□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
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CCL20-201ENST00000358813 CD163Q86VB7 1156 aa7.57□□□□□ -1.2
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CCL20-201ENST00000358813 LIN7BQ9HAP6 207 aa7.57□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 SPC25Q9HBM1 224 aa7.57□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 IFT57Q9NWB7 429 aa7.57□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 AKAP2Q9Y2D5 859 aa7.57□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 PRKAB1Q9Y478 270 aa7.57□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 CHRNA4P43681 627 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 SETDB1Q15047 1291 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 MAP3K11Q16584 847 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 TNNI3KQ59H18 835 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 DCAF11Q8TEB1 546 aa7.56□□□□□ -1.2
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CCL20-201ENST00000358813 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
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CCL20-201ENST00000358813 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
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CCL20-201ENST00000358813 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 FAM135BQ49AJ0 1406 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
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CCL20-201ENST00000358813 SELPP16109 830 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 RASA3Q14644 834 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 SNAP47Q5SQN1 464 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 PCNX4Q63HM2 1172 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 FBXL19Q6PCT2 694 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 PHC3Q8NDX5 983 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 NKD1Q969G9 470 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 RHOVQ96L33 236 aa7.55□□□□□ -1.2
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CCL20-201ENST00000358813 PCDH12Q9NPG4 1184 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 SOX13Q9UN79 622 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 TMEM94Q12767 1356 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 JCADQ9P266 1359 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 ERVK-7P63135 1459 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 TIAM1Q13009 1591 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 METTL12A8MUP2 240 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 H3BRJ5 948 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 MSTNO14793 375 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 FSCN2O14926 492 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 LIG3P49916 1009 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 LMNB2Q03252 620 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 APOBRQ0VD83 1088 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 TAF7LQ5H9L4 462 aa7.54□□□□□ -1.2
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CCL20-201ENST00000358813 CCNJLQ8IV13 435 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 TCF12Q99081 682 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 CCDC113Q9H0I3 377 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 CEP162Q5TB80 1403 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 DLL1O00548 723 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 CDC45O75419 566 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 IGHA1P01876 353 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 PF4P02776 101 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 GARTP22102 1010 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 RXRBP28702 533 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CCL20-201ENST00000358813 FAM160A1Q05DH4 1040 aa7.53□□□□□ -1.2
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