RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335523.7

VSTM2B-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VSTM2B, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2B-201ENST00000335523 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.95■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 HACL1Q9UJ83 578 aa22.95■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 FOCADQ5VW36 1801 aa22.94■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa22.94■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.94■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.94■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 LY9Q9HBG7 655 aa22.94■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.94■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 MYH1P12882 1939 aa22.94■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa22.93■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 CCDC69A6NI79 296 aa22.93■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 RASA3Q14644 834 aa22.93■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.93■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.93■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 CCDC17Q96LX7 622 aa22.93■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 TNKSO95271 1327 aa22.93■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 CNTNAP1P78357 1384 aa22.93■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 PFKFB2O60825 505 aa22.92■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 LAMB1P07942 1786 aa22.92■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.92■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 LARGE1O95461 756 aa22.92■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 SHMT1P34896 483 aa22.92■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 SEC23AQ15436 765 aa22.92■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 DGKHQ86XP1 1220 aa22.92■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.92■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.92■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.92■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 STK3Q13188 491 aa22.91■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.91■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 NECAB1Q8N987 351 aa22.91■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.91■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 TBC1D12O60347 775 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 ANKS1AQ92625 1134 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 GTF3C6Q969F1 213 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.9■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
VSTM2B-201ENST00000335523 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.89■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 GOLGA8BA8MQT2 603 aa22.89■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 ZBTB43O43298 467 aa22.89■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.89■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 HOOK2Q96ED9 719 aa22.89■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 RCAN1P53805 252 aa22.88■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 APOA5Q6Q788 366 aa22.88■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.88■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 DNAJC18Q9H819 358 aa22.88■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 SENP2Q9HC62 589 aa22.88■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.88■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 PGAP2Q9UHJ9 254 aa22.88■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.88■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.87■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 NMT2O60551 498 aa22.87■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 AKR1B1P15121 316 aa22.87■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 GGA3Q9NZ52 723 aa22.87■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 KIF3CO14782 793 aa22.86■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 CALM1P0DP23 149 aa22.86■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 CALM2P0DP24 149 aa22.86■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 CALM3P0DP25 149 aa22.86■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 EPHX2P34913 555 aa22.86■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 CCT2P78371 535 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 SCRN1Q12765 414 aa22.86■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 KAT14Q9H8E8 782 aa22.86■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.86■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM196BA6NMK8 535 aa22.85■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 MAP3K10Q02779 954 aa22.85■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 PPP2R5BQ15173 497 aa22.85■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.85■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 TEPSINQ96N21 525 aa22.85■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 CABP5Q9NP86 173 aa22.85■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 STX8Q9UNK0 236 aa22.85■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.85■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.85■■□□□ 1.25
VSTM2B-201ENST00000335523 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms