RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320122.10

LMO3-202, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,759 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-202ENST00000320122 XAGE2Q96GT9 111 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 MYH15Q9Y2K3 1946 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 M0R2C6 588 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 MFAP3LO75121 409 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 PPFIA4O75335 1185 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 ISM2Q6H9L7 571 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 WDR93Q6P2C0 686 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 CHST3Q7LGC8 479 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 PLCD4Q9BRC7 762 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 YY1AP1Q9H869 796 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 LTN1O94822 1766 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 ERBB3P21860 1342 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 DTNBO60941 627 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 KIAA0754O94854 1291 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 MMP1P03956 469 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 MYL1P05976 194 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 PCP11498 1178 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 APBA1Q02410 837 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 ATG9AQ7Z3C6 839 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 KIAA1328Q86T90 577 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 C10orf67Q8IYJ2 551 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 RETREG2Q8NC44 543 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 CNNM1Q9NRU3 951 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 TOMM22Q9NS69 142 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 RSPH14Q9UHP6 348 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 MYO6Q9UM54 1294 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 EBAG9O00559 213 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 TRAPPC10P48553 1259 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 CDR1P51861 262 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 SLC39A6Q13433 755 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 LONRF3Q496Y0 759 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 KRT28Q7Z3Y7 464 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 FAM76AQ8TAV0 307 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 PDE11AQ9HCR9 933 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 LZTFL1Q9NQ48 299 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 SERTAD1Q9UHV2 236 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 HPS5Q9UPZ3 1129 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 ERVV-2B6SEH9 535 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 CLSTN1O94985 981 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 ADD2P35612 726 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 KRT2P35908 639 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 FOXO4P98177 505 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 KIFC2Q96AC6 838 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 PLA2G12BQ9BX93 195 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 ANO9A1A5B4 782 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 DCAF8L1A6NGE4 600 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 H7C1D1 291 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 SLC5A1P13866 664 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 CASP7P55210 303 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 ADKP55263 362 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 PPFIA1Q13136 1202 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 CASP8Q14790 479 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 AMOTL1Q8IY63 956 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 TRERF1Q96PN7 1200 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 WDR24Q96S15 920 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 GOLGA8KD6RF30 607 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 IDH1O75874 414 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 TDO2P48775 406 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 SARSP49591 514 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 SPA17Q15506 151 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 TTLL5Q6EMB2 1281 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 CCDC155Q8N6L0 562 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 OR8K1Q8NGG5 319 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 DPF2Q92785 391 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 MAP3K14Q99558 947 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 L1RE1Q9UN81 338 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 KIF28PB7ZC32 967 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 PAK1Q13153 545 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 CATIPQ7Z7H3 387 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 TMEM139Q8IV31 216 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 ESR2Q92731 530 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 ALS2CR12Q96Q35 445 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 MAGEF1Q9HAY2 307 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 RWDD2AQ9UIY3 292 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 SAR1BQ9Y6B6 198 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 NID2Q14112 1375 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 BICDL2A1A5D9 508 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 TMEM232C9JQI7 657 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-202ENST00000320122 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms