RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291901.12

TNNT1-201, Transcript of troponin T1, slow skeletal type, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNNT1, Length 967 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1-201ENST00000291901 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
TNNT1-201ENST00000291901 ASNSP08243 561 aa20.47■□□□□ 0.87
TNNT1-201ENST00000291901 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
TNNT1-201ENST00000291901 BACE1P56817 501 aa20.47■□□□□ 0.87
TNNT1-201ENST00000291901 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.47■□□□□ 0.87
TNNT1-201ENST00000291901 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa20.47■□□□□ 0.87
TNNT1-201ENST00000291901 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
TNNT1-201ENST00000291901 PANK1Q8TE04 598 aa20.47■□□□□ 0.87
TNNT1-201ENST00000291901 WDR18Q9BV38 432 aa20.47■□□□□ 0.87
TNNT1-201ENST00000291901 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.47■□□□□ 0.87
TNNT1-201ENST00000291901 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
TNNT1-201ENST00000291901 CEP85Q6P2H3 762 aa20.46■□□□□ 0.87
TNNT1-201ENST00000291901 MAGEB6Q8N7X4 407 aa20.46■□□□□ 0.87
TNNT1-201ENST00000291901 HTATIP2Q9BUP3 242 aa20.46■□□□□ 0.87
TNNT1-201ENST00000291901 ANTXR1Q9H6X2 564 aa20.46■□□□□ 0.87
TNNT1-201ENST00000291901 HLA-DOAP06340 250 aa20.45■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 AACSQ86V21 672 aa20.45■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 BCL11AQ9H165 835 aa20.45■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.45■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 USP17L10C9JJH3 530 aa20.44■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 USP5P45974 858 aa20.44■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 APBB1O00213 710 aa20.43■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 TRIM32Q13049 653 aa20.43■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.43■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 C19orf81C9J6K1 198 aa20.42■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.42■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 MORF4L1Q9UBU8 362 aa20.42■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 GJD2Q9UKL4 321 aa20.42■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 ALPK3Q96L96 1907 aa20.42■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 GH2P01242 217 aa20.41■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 HERVK_113P62684 666 aa20.41■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 EMILIN3Q9NT22 766 aa20.41■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 HMGCRP04035 888 aa20.4■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 CYP2B6P20813 491 aa20.4■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 MAP3K12Q12852 859 aa20.4■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 ERC1Q8IUD2 1116 aa20.4■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 NAV1Q8NEY1 1877 aa20.4■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa20.4■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 PAGR1Q9BTK6 254 aa20.4■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa20.4■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.4■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.4■□□□□ 0.86
TNNT1-201ENST00000291901 IGSF3O75054 1194 aa20.39■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 Q3C1V9 767 aa20.39■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 TRIB2Q92519 343 aa20.39■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa20.39■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 GINM1Q9NU53 330 aa20.39■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.38■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 EVI5O60447 810 aa20.38■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 RAB3GAP1Q15042 981 aa20.38■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.38■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 RHPN1Q8TCX5 695 aa20.38■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 FEZ1Q99689 392 aa20.38■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 SERPINB13Q9UIV8 391 aa20.38■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 PLCD1P51178 756 aa20.37■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 TATDN1Q6P1N9 297 aa20.37■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 POTEEQ6S8J3 1075 aa20.37■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 PORCNQ9H237 461 aa20.37■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 RPTORQ8N122 1335 aa20.36■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa20.36■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 ERVK-9P63128 1117 aa20.36■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 ERVK-24P63145 666 aa20.36■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 TTC6Q86TZ1 520 aa20.36■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 CERS3Q8IU89 383 aa20.36■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.36■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 EVX2Q03828 476 aa20.35■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 ABCB5Q2M3G0 1257 aa20.35■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.35■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa20.35■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 NECAB2Q7Z6G3 386 aa20.35■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 ACER1Q8TDN7 264 aa20.35■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 EHD4Q9H223 541 aa20.35■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 COG6Q9Y2V7 657 aa20.35■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 GOLIM4O00461 696 aa20.34■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 PDE6AP16499 860 aa20.34■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 MAPK4P31152 587 aa20.34■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 PDE3AQ14432 1141 aa20.34■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 GPR142Q7Z601 462 aa20.34■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 MYH8P13535 1937 aa20.33■□□□□ 0.85
TNNT1-201ENST00000291901 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms