RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233331.11

INO80B-201, Transcript of INO80 complex subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene INO80B, Length 1,261 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80B-201ENST00000233331 GINM1Q9NU53 330 aa36.92■■■■□ 3.5
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INO80B-201ENST00000233331 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa36.91■■■■□ 3.5
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INO80B-201ENST00000233331 SH3D19Q5HYK7 790 aa36.82■■■■□ 3.48
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INO80B-201ENST00000233331 HPS5Q9UPZ3 1129 aa36.82■■■■□ 3.48
INO80B-201ENST00000233331 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa36.81■■■■□ 3.48
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INO80B-201ENST00000233331 USP17L21D6R901 530 aa36.81■■■■□ 3.48
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INO80B-201ENST00000233331 USP17L10C9JJH3 530 aa36.8■■■■□ 3.48
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INO80B-201ENST00000233331 PNMA3Q9UL41 463 aa36.79■■■■□ 3.48
INO80B-201ENST00000233331 CTR9Q6PD62 1173 aa36.78■■■■□ 3.48
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INO80B-201ENST00000233331 BCRP11274 1271 aa36.76■■■■□ 3.48
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INO80B-201ENST00000233331 GUCY1A2P33402 732 aa36.74■■■■□ 3.47
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INO80B-201ENST00000233331 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
INO80B-201ENST00000233331 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa36.72■■■■□ 3.47
INO80B-201ENST00000233331 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa36.71■■■■□ 3.47
INO80B-201ENST00000233331 SBK1Q52WX2 424 aa36.71■■■■□ 3.47
INO80B-201ENST00000233331 ACER1Q8TDN7 264 aa36.71■■■■□ 3.47
INO80B-201ENST00000233331 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
INO80B-201ENST00000233331 AKR1B1P15121 316 aa36.7■■■■□ 3.47
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