RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP21.03■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 NFKBIEO00221 500 aa21.02■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 GUCY1A2P33402 732 aa21.02■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa21.02■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.02■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 RTKN2Q8IZC4 609 aa21.02■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 EYA3Q99504 573 aa21.02■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 CBX8Q9HC52 389 aa21.02■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa21.02■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 NID2Q14112 1375 aa21.02■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 ERICH2A1L162 156 aa21.02■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 PRDM1O75626 825 aa21.02■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 IL1R1P14778 569 aa21.02■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 GTF2IP78347 998 aa21.02■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 FAM160A1Q05DH4 1040 aa21.02■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 SASS6Q6UVJ0 657 aa21.02■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.02■□□□□ 0.96
USP18-201ENST00000215794 TNKSO95271 1327 aa21.02■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 SCN9AQ15858 1988 aa21.01■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 A0A1B0GVL5 298 aa21.01■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 RTN1Q16799 776 aa21.01■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 CTR9Q6PD62 1173 aa21.01■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 NUP133Q8WUM0 1156 aa21.01■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 UBAC1Q9BSL1 405 aa21.01■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 DNAJC25Q9H1X3 360 aa21.01■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 SPTLC2O15270 562 aa21.01■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 ECE2O60344 883 aa21.01■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 YEATS4O95619 227 aa21.01■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa21.01■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 ANO1Q5XXA6 986 aa21.01■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 ADALQ6DHV7 355 aa21.01■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 ZNF654Q8IZM8 581 aa21.01■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 ESR2Q92731 530 aa21.01■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 MYH2Q9UKX2 1941 aa21■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 A0A087WWV3 80 aa21■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 IFNAR1P17181 557 aa21■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 SEC23AQ15436 765 aa21■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 KCNG4Q8TDN1 519 aa21■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 PKNOX2Q96KN3 472 aa21■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 COA1Q9GZY4 146 aa21■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa21■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 STK36Q9NRP7 1315 aa21■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 USP17L12C9JPN9 530 aa20.99■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 USP17L21D6R901 530 aa20.99■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 KINO60870 393 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 PRELPP51888 382 aa20.99■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 NDUFA8P51970 172 aa20.99■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 NBPF11Q86T75 865 aa20.99■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.99■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 PSMD1Q99460 953 aa20.99■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 TAOK3Q9H2K8 898 aa20.99■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP20.99■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 MAST2Q6P0Q8 1798 aa20.98■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 YDJCA8MPS7 323 aa20.98■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP20.98■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 A0A1W2PQ27 194 aa20.98■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 A0A1W2PQ64 194 aa20.98■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 A0A1W2PQD8 194 aa20.98■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 F8W031 263 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 TRIM29Q14134 588 aa20.98■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 RGS22Q8NE09 1264 aa20.98■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 MTA3Q9BTC8 594 aa20.98■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20.97■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 CYP2D6P10635 497 aa20.97■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 MFSD14BQ5SR56 506 aa20.97■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 SOGA3Q5TF21 947 aa20.97■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 FANCBQ8NB91 859 aa20.97■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 SUPT20HQ8NEM7 779 aa20.97■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP20.97■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 KCNJ14Q9UNX9 436 aa20.97■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP20.96■□□□□ 0.956e-6■■■■□ 22.5
USP18-201ENST00000215794 ZNF165P49910 485 aa20.96■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa20.96■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 TMTC2Q8N394 836 aa20.96■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 CERS5Q8N5B7 392 aa20.96■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa20.96■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa20.96■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 CTAGE5O15320 804 aa20.96■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa20.96■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
USP18-201ENST00000215794 SLC39A14Q15043 492 aa20.95■□□□□ 0.94
USP18-201ENST00000215794 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms