RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026252.13

Ldb1-201, Transcript of LIM domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ldb1, Length 1,718 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Atp1a3Q6PIC6 1013 aa21.8■■□□□ 1.08
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Zscan18E9PUD6 809 aa21.8■■□□□ 1.08
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Trmt2aQ8BNV1 574 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mad2l2Q9D752 211 aa21.8■■□□□ 1.08
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gm9048A0A1W2P7H4 802 aa21.79■■□□□ 1.08
Ldb1-201ENSMUST00000026252 A0A1W2P7Z8 802 aa21.79■■□□□ 1.08
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gm9046A0A1W2P855 802 aa21.79■■□□□ 1.08
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Nap1l2P51860 460 aa21.79■■□□□ 1.08
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 RabggtaQ9JHK4 567 aa21.79■■□□□ 1.08
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 AV320801A2AWL3 467 aa21.77■■□□□ 1.08
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gm15023L7MUB4 467 aa21.77■■□□□ 1.08
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ptf1aQ9QX98 324 aa21.77■■□□□ 1.08
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Col5a2Q3U962 1497 aa21.77■■□□□ 1.08
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ubxn4Q8VCH8 506 aa21.77■■□□□ 1.08
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Arid4aF8VPQ2 1261 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cyp2c67Q569X9 491 aa21.76■■□□□ 1.07
Ldb1-201ENSMUST00000026252 MycbpapQ5SUV2 932 aa21.76■■□□□ 1.07
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Snw1Q9CSN1 536 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Etnk1Q9D4V0 363 aa21.76■■□□□ 1.07
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Fdx1P46656 188 aa21.75■■□□□ 1.07
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Scnn1aQ61180 699 aa21.75■■□□□ 1.07
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Snx13Q6PHS6 957 aa21.75■■□□□ 1.07
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Olfml1Q8BSH2 233 aa21.75■■□□□ 1.07
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tcp11l1Q8BTG3 509 aa21.75■■□□□ 1.07
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ttc27Q8CD92 847 aa21.75■■□□□ 1.07
Ldb1-201ENSMUST00000026252 OplahQ8K010 1288 aa21.75■■□□□ 1.07
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Lzts2Q91YU6 671 aa21.74■■□□□ 1.07
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Trim44Q9QXA7 346 aa21.74■■□□□ 1.07
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tpd52l1O54818 204 aa21.73■■□□□ 1.07
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 OscarQ8VBT3 265 aa21.73■■□□□ 1.07
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Hps3Q91VB4 1002 aa21.73■■□□□ 1.07
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Yipf1Q91VU1 306 aa21.73■■□□□ 1.07
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Klhl34A2AI76 644 aa21.72■■□□□ 1.07
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Kansl3A2RSY1 903 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Clec11aO88200 328 aa21.72■■□□□ 1.07
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ccdc162pQ0VG85 912 aa21.72■■□□□ 1.07
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cyp4x1Q6A152 507 aa21.72■■□□□ 1.07
Ldb1-201ENSMUST00000026252 E4f1Q8CCE9 783 aa21.72■■□□□ 1.07
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Trmt112Q9DCG9 125 aa21.72■■□□□ 1.07
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Pcdhb14Q6PB90 796 aa21.72■■□□□ 1.07
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