RNA–Protein interactions for RNA: YHL002W

HSE1, Transcript of Subunit of the endosomal Vps27p-Hse1p complex, yeast

Gene HSE1, Length 1,359 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HSE1	YHL002W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HSE1	YHL002W	YCR061W	P25639	631 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HSE1	YHL002W	SWD1	P39706	426 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HSE1	YHL002W	POL31	P46957	487 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HSE1	YHL002W	YNL034W	P53963	612 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HSE1	YHL002W	AAT1	Q01802	451 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HSE1	YHL002W	VPS64	Q03944	604 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HSE1	YHL002W	CRF1	Q04930	467 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HSE1	YHL002W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HSE1	YHL002W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HSE1	YHL002W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HSE1	YHL002W	VPS8	P39702	1274 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HSE1	YHL002W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HSE1	YHL002W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HSE1	YHL002W	IRC7	P43623	340 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HSE1	YHL002W	SND1	Q04007	877 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HSE1	YHL002W	PLM2	Q04383	521 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HSE1	YHL002W	YML053C	Q04978	212 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HSE1	YHL002W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HSE1	YHL002W	AAD4	Q07747	329 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HSE1	YHL002W	LCB4	Q12246	624 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HSE1	YHL002W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HSE1	YHL002W	NIC96	P34077	839 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HSE1	YHL002W	IMA5	P40884	581 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HSE1	YHL002W	TGL2	P54857	326 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HSE1	YHL002W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HSE1	YHL002W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HSE1	YHL002W	MPD2	Q99316	277 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HSE1	YHL002W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HSE1	YHL002W	JHD1	P40034	492 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HSE1	YHL002W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HSE1	YHL002W	CRC1	Q12289	327 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HSE1	YHL002W	ARP7	Q12406	477 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HSE1	YHL002W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HSE1	YHL002W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	MAK32	P23060	363 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	FTH1	P38310	465 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	PEX8	P53248	589 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	MPS1	P54199	764 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	RTC1	Q08281	1341 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	SIP1	P32578	815 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	TOM20	P35180	183 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	MNT3	P40549	630 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	AIM6	Q07716	390 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	GEP3	Q08622	556 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	SWC3	P31376	625 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	CIN1	P40987	1014 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	MAD3	P47074	515 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	YAT1	P80235	687 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	PDE1	P22434	369 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	YKL133C	P36066	463 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	SPC97	P38863	823 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	YIL024C	P40543	189 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	CFD1	P40558	293 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	RAD34	Q06665	692 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	YPR089W	O13585	888 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	COQ3	P27680	312 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	GRX7	P38068	203 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	TEP1	P53916	434 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	ICL2	Q12031	575 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HSE1	YHL002W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.69
HSE1	YHL002W	PCI8	P40512	444 aa		4.53	□□□□□ -1.69
HSE1	YHL002W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.69
HSE1	YHL002W	PTC6	P25646	442 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HSE1	YHL002W	CAB2	P40506	365 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HSE1	YHL002W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
HSE1	YHL002W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
HSE1	YHL002W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HSE1	YHL002W	ATG21	Q02887	496 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HSE1	YHL002W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HSE1	YHL002W	SIR1	P21691	654 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HSE1	YHL002W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
HSE1	YHL002W	ASK1	P35734	292 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HSE1	YHL002W	APM3	P38153	483 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HSE1	YHL002W	ERC1	P38767	581 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HSE1	YHL002W	FLO5	P38894	1075 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HSE1	YHL002W	MET14	Q02196	202 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HSE1	YHL002W	ARA2	Q04212	335 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HSE1	YHL002W	POL3	P15436	1097 aa		4.5	□□□□□ -1.69
HSE1	YHL002W	MGM1	P32266	881 aa		4.5	□□□□□ -1.69
HSE1	YHL002W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69

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