RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	PMEPA1	Q969W9	287 aa		7.59	□□□□□ -1.19
MLH1-223	ENST00000616768	AKAP12	Q02952	1782 aa		7.59	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		7.59	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		7.58	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		7.58	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	LBX1	P52954	281 aa		7.58	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	EHHADH	Q08426	723 aa		7.58	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	MBTPS1	Q14703	1052 aa		7.58	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		7.58	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		7.58	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	EDEM1	Q92611	657 aa		7.58	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	SPACA7	Q96KW9	195 aa		7.58	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		7.58	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		7.58	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	CLTCL1	P53675	1640 aa		7.57	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	DLL1	O00548	723 aa		7.57	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		7.57	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	CEP120	Q8N960	986 aa		7.57	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		7.57	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		7.57	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		7.57	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		7.56	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	DAPK1	P53355	1430 aa		7.56	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	DDB1	Q16531	1140 aa		7.56	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		7.56	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		7.56	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	STK26	Q9P289	416 aa		7.56	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		7.56	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	7.55	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	FURIN	P09958	794 aa		7.55	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		7.55	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		7.55	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	TTC16	Q8NEE8	873 aa		7.55	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	PBX4	Q9BYU1	374 aa		7.55	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		7.55	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	CNTN3	Q9P232	1028 aa		7.55	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		7.55	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	FZD6	O60353	706 aa		7.54	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	ICMT	O60725	284 aa		7.54	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		7.54	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		7.54	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	MTMR3	Q13615	1198 aa		7.54	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	DOC2B	Q14184	412 aa		7.54	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		7.54	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	GJD3	Q8N144	294 aa		7.54	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	ADAM19	Q9H013	955 aa		7.54	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	POLI	Q9UNA4	740 aa		7.54	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		7.54	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	PPME1	Q9Y570	386 aa		7.54	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	CARNS1	A5YM72	827 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	SETDB1	Q15047	1291 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	CHRD	Q9H2X0	955 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	NHS	Q6T4R5	1651 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MLH1-223	ENST00000616768	TM4SF5	O14894	197 aa		7.52	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	CES1	P23141	567 aa		7.52	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	ECM1	Q16610	540 aa		7.52	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		7.52	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		7.52	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		7.52	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	WNT8B	Q93098	351 aa		7.52	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		7.52	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	BTAF1	O14981	1849 aa		7.52	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		7.52	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	NFKBIE	O00221	500 aa		7.51	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	TNFRSF21	O75509	655 aa		7.51	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	CDC27	P30260	824 aa		7.51	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	ATP11A	P98196	1134 aa		7.51	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	C8orf34	Q49A92	452 aa		7.51	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	CEP135	Q66GS9	1140 aa		7.51	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		7.51	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		7.51	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		7.5	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	PTPRA	P18433	802 aa		7.5	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768		Q6ZS46	218 aa		7.5	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	RETREG2	Q8NC44	543 aa		7.5	□□□□□ -1.21
MLH1-223	ENST00000616768	CITED4	Q96RK1	184 aa		7.5	□□□□□ -1.21

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