RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 HLA-DOAP06340 250 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 CALM1P0DP23 149 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 CALM2P0DP24 149 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 CALM3P0DP25 149 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 ANTXR2P58335 489 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 CERS5Q8N5B7 392 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 LTBP3Q9NS15 1303 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 STX6O43752 255 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 TNIP1Q15025 636 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 CLEC17AQ6ZS10 378 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 CYB5R4Q7L1T6 521 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 TMOD2Q9NZR1 351 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 NAV1Q8NEY1 1877 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 FLT1P17948 1338 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 BRD1O95696 1058 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 TSPY2A6NKD2 308 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 RHBDL3P58872 404 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 SCRN1Q12765 414 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 NBR1Q14596 966 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 KIAA0825Q8IV33 1275 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 RGS22Q8NE09 1264 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 BCS1LQ9Y276 419 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 NPM3O75607 178 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 MCM4P33991 863 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 CATIPQ7Z7H3 387 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 AGBL3Q8NEM8 1001 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 LY9Q9HBG7 655 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 H3BQV1 296 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 VIL1P09327 827 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 USP17L8P0C7I0 530 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 SCNN1DP51172 638 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 SWAP70Q9UH65 585 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-212ENST00000591041 GOLGA8AA7E2F4 631 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 SYT1P21579 422 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 APOA5Q6Q788 366 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 WASF1Q92558 559 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 TNKSO95271 1327 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 CCT2P78371 535 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 STK11IPQ8N1F8 1099 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM34Q9BYJ4 488 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 PTPDC1A2A3K4 754 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 CIAPIN1Q6FI81 312 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 C16orf86Q6ZW13 317 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 PSME4Q14997 1843 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 TSPY3P0CV98 308 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 TSPY8P0CW00 308 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 RPS12P25398 132 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 PICALMQ13492 652 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM22Q8IYM9 498 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 BRPF3Q9ULD4 1205 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 NID2Q14112 1375 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 MYO1BO43795 1136 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 DDAH1O94760 285 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 HSPA6P17066 643 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 EIF6P56537 245 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 DLGAP5Q15398 846 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 DGKHQ86XP1 1220 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 MXD3Q9BW11 206 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 IDI2Q9BXS1 227 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 FOCADQ5VW36 1801 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 YDJCA8MPS7 323 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 BAG4O95429 457 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 CYP2D6P10635 497 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 ST3GAL1Q11201 340 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 RTN1Q16799 776 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 MICU3Q86XE3 530 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 KCNQ5Q9NR82 932 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa26.39■■□□□ 1.82
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