RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521611.1

RB1CC1-208, Transcript of RB1 inducible coiled-coil 1, human

TSL 5

Gene RB1CC1, Length 528 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RB1CC1-208	ENST00000521611	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		27.9	■■■□□ 2.06
RB1CC1-208	ENST00000521611	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		27.9	■■■□□ 2.06
RB1CC1-208	ENST00000521611	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
RB1CC1-208	ENST00000521611	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	27.9	■■■□□ 2.06	5e-7	■■■■□ 21.5
RB1CC1-208	ENST00000521611	LRCH3	Q96II8	777 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RB1CC1-208	ENST00000521611	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RB1CC1-208	ENST00000521611	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RB1CC1-208	ENST00000521611	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RB1CC1-208	ENST00000521611	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RB1CC1-208	ENST00000521611	ZBTB22	O15209	634 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RB1CC1-208	ENST00000521611	SRGAP3	O43295	1099 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RB1CC1-208	ENST00000521611	TBC1D12	O60347	775 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RB1CC1-208	ENST00000521611	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
RB1CC1-208	ENST00000521611	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
RB1CC1-208	ENST00000521611	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RB1CC1-208	ENST00000521611	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RB1CC1-208	ENST00000521611	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		27.87	■■■□□ 2.05
RB1CC1-208	ENST00000521611	TRIM32	Q13049	653 aa		27.87	■■■□□ 2.05
RB1CC1-208	ENST00000521611	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
RB1CC1-208	ENST00000521611	RAI14	Q9P0K7	980 aa		27.87	■■■□□ 2.05
RB1CC1-208	ENST00000521611	GORAB	Q5T7V8	394 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RB1CC1-208	ENST00000521611	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RB1CC1-208	ENST00000521611	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RB1CC1-208	ENST00000521611	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
RB1CC1-208	ENST00000521611	SPATA5	Q8NB90	893 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RB1CC1-208	ENST00000521611	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
RB1CC1-208	ENST00000521611	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
RB1CC1-208	ENST00000521611	HMGCR	P04035	888 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RB1CC1-208	ENST00000521611	CAP2	P40123	477 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RB1CC1-208	ENST00000521611	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
RB1CC1-208	ENST00000521611	GSTO1	P78417	241 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RB1CC1-208	ENST00000521611	TEX11	Q8IYF3	940 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RB1CC1-208	ENST00000521611	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RB1CC1-208	ENST00000521611		A0A1W2PPC1	479 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RB1CC1-208	ENST00000521611	PEX10	O60683	326 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RB1CC1-208	ENST00000521611	LDHC	P07864	332 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RB1CC1-208	ENST00000521611	USP17L5	A8MUK1	530 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	27.82	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	GJD2	Q9UKL4	321 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611		A0A0C4DFX4	3053 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	GNAI3	P08754	354 aa		27.8	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	SYN1	P17600	705 aa		27.8	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	CAPN2	P17655	700 aa		27.8	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	MTMR2	Q13614	643 aa		27.8	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		27.8	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	PLXNB2	O15031	1838 aa		27.79	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	RPTOR	Q8N122	1335 aa		27.79	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	CYP2B6	P20813	491 aa		27.79	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	MCAM	P43121	646 aa		27.79	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	TRIB2	Q92519	343 aa		27.79	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		27.79	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	DLL1	O00548	723 aa		27.78	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		27.78	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		27.78	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	SNRK	Q9NRH2	765 aa		27.78	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	SIPA1L1	O43166	1804 aa		27.77	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	JAG1	P78504	1218 aa		27.77	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	MTX1	Q13505	466 aa		27.77	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		27.77	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	GDF15	Q99988	308 aa		27.77	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	NBPF3	Q9H094	633 aa		27.77	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	27.77	■■■□□ 2.04	2e-8	■■■■□ 20.1
RB1CC1-208	ENST00000521611	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
RB1CC1-208	ENST00000521611	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
RB1CC1-208	ENST00000521611	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		27.76	■■■□□ 2.03
RB1CC1-208	ENST00000521611	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
RB1CC1-208	ENST00000521611	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		27.76	■■■□□ 2.03
RB1CC1-208	ENST00000521611	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		27.76	■■■□□ 2.03
RB1CC1-208	ENST00000521611	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		27.76	■■■□□ 2.03
RB1CC1-208	ENST00000521611	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RB1CC1-208	ENST00000521611	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RB1CC1-208	ENST00000521611	TNN	Q9UQP3	1299 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RB1CC1-208	ENST00000521611	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RB1CC1-208	ENST00000521611	GDF11	O95390	407 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RB1CC1-208	ENST00000521611	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
RB1CC1-208	ENST00000521611	BACE1	P56817	501 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RB1CC1-208	ENST00000521611	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	27.74	■■■□□ 2.03
RB1CC1-208	ENST00000521611	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RB1CC1-208	ENST00000521611	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
RB1CC1-208	ENST00000521611	WDR18	Q9BV38	432 aa		27.73	■■■□□ 2.03
RB1CC1-208	ENST00000521611	DNAJC18	Q9H819	358 aa		27.73	■■■□□ 2.03
RB1CC1-208	ENST00000521611	ASNS	P08243	561 aa		27.72	■■■□□ 2.03
RB1CC1-208	ENST00000521611	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		27.72	■■■□□ 2.03
RB1CC1-208	ENST00000521611	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
RB1CC1-208	ENST00000521611	HERVK_113	P62684	666 aa		27.72	■■■□□ 2.03
RB1CC1-208	ENST00000521611	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
RB1CC1-208	ENST00000521611	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		27.72	■■■□□ 2.03

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