RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496465.1

TM2D1-211, Transcript of TM2 domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TM2D1, Length 577 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1-211ENST00000496465 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.25■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 MGAMO43451 1857 aa22.25■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 MYH1P12882 1939 aa22.25■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 FAM196BA6NMK8 535 aa22.24■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 HMMRO75330 724 aa22.24■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa22.24■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.24■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 CPA4Q9UI42 421 aa22.24■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.24■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.23■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.23■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.22■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 CYP7A1P22680 504 aa22.22■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 CAP2P40123 477 aa22.22■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.22■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.22■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 FLT1P17948 1338 aa22.22■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 TRIM75PA6NK02 468 aa22.21■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 PRMT2P55345 433 aa22.21■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 PDE3AQ14432 1141 aa22.21■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 CERS3Q8IU89 383 aa22.21■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.21■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.21■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.21■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.21■■□□□ 1.15
TM2D1-211ENST00000496465 CYP2C8P10632 490 aa22.2■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 BCRP11274 1271 aa22.2■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.2■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 BRCA2P51587 3418 aa22.2■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 RAB11FIP3O75154 756 aa22.19■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 CTGFP29279 349 aa22.19■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 MAP3K12Q12852 859 aa22.19■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.19■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 NBPF11Q86T75 865 aa22.19■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 MAGEB6Q8N7X4 407 aa22.19■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 ZNF333Q96JL9 665 aa22.19■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 TRIM47Q96LD4 638 aa22.19■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 PSMC4P43686 418 aa22.18■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 ZNF280CQ8ND82 737 aa22.18■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 PALD1Q9ULE6 856 aa22.18■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.18■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 POTEFA5A3E0 1075 aa22.17■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 USP17L5A8MUK1 530 aa22.17■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 APBB1O00213 710 aa22.17■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 SPP2Q13103 211 aa22.17■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.17■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 DNAJC18Q9H819 358 aa22.17■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 HOXD10P28358 340 aa22.16■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.16■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 SRRDQ9UH36 339 aa22.16■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 ASNSP08243 561 aa22.15■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 OSBPP22059 807 aa22.15■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 WDR18Q9BV38 432 aa22.15■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.15■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 GINM1Q9NU53 330 aa22.15■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.14■■□□□ 1.14
TM2D1-211ENST00000496465 HLA-DOAP06340 250 aa22.14■■□□□ 1.13
TM2D1-211ENST00000496465 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.14■■□□□ 1.13
TM2D1-211ENST00000496465 TREML2Q5T2D2 321 aa22.14■■□□□ 1.13
TM2D1-211ENST00000496465 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
TM2D1-211ENST00000496465 USP5P45974 858 aa22.13■■□□□ 1.13
TM2D1-211ENST00000496465 FCGRTP55899 365 aa22.13■■□□□ 1.13
TM2D1-211ENST00000496465 JAG1P78504 1218 aa22.13■■□□□ 1.13
TM2D1-211ENST00000496465 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TM2D1-211ENST00000496465 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TM2D1-211ENST00000496465 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.13■■□□□ 1.13
TM2D1-211ENST00000496465 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.13■■□□□ 1.13
TM2D1-211ENST00000496465 PNMA3Q9UL41 463 aa22.13■■□□□ 1.13
TM2D1-211ENST00000496465 MYH7P12883 1935 aa22.13■■□□□ 1.13
TM2D1-211ENST00000496465 NAV1Q8NEY1 1877 aa22.13■■□□□ 1.13
TM2D1-211ENST00000496465 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TM2D1-211ENST00000496465 PDE6AP16499 860 aa22.12■■□□□ 1.13
TM2D1-211ENST00000496465 HMGCS2P54868 508 aa22.12■■□□□ 1.13
TM2D1-211ENST00000496465 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.12■■□□□ 1.13
TM2D1-211ENST00000496465 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.12■■□□□ 1.13
TM2D1-211ENST00000496465 MYPNQ86TC9 1320 aa22.11■■□□□ 1.13
TM2D1-211ENST00000496465 GOLIM4O00461 696 aa22.11■■□□□ 1.13
TM2D1-211ENST00000496465 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
TM2D1-211ENST00000496465 EHD4Q9H223 541 aa22.11■■□□□ 1.13
TM2D1-211ENST00000496465 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.1■■□□□ 1.13
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