RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	PDHX	O00330	501 aa		21.01	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	21.01	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		21.01	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	21.01	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	21	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP7A1	P22680	504 aa		21	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	CAP2	P40123	477 aa		21	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		21	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	ARMC5	Q96C12	935 aa		21	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	CRBN	Q96SW2	442 aa		21	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	20.99	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		20.99	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	20.99	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		20.99	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		20.99	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	FLT1	P17948	1338 aa		20.99	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		20.99	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	ASNS	P08243	561 aa		20.98	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP5J	P18859	108 aa		20.98	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR18	Q9BV38	432 aa		20.98	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		20.98	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	DOCK2	Q92608	1830 aa		20.97	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	USP17L5	A8MUK1	530 aa		20.97	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	HLA-DOA	P06340	250 aa		20.97	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	HOXD10	P28358	340 aa		20.97	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		20.97	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	NBPF11	Q86T75	865 aa		20.97	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	EHD4	Q9H223	541 aa		20.97	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		20.97	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		20.96	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	20.96	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	20.96	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		20.96	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		20.96	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		20.96	■□□□□ 0.95
HDAC10-216	ENST00000489424	BCR	P11274	1271 aa		20.95	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	TTC6	Q86TZ1	520 aa		20.95	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		20.95	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	PNMA3	Q9UL41	463 aa		20.95	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		20.95	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		20.94	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	20.94	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	DCTPP1	Q9H773	170 aa		20.94	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		20.93	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	C19orf81	C9J6K1	198 aa		20.93	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		20.93	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	20.93	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		20.93	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	20.92	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM75P	A6NK02	468 aa		20.92	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	USP5	P45974	858 aa		20.92	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	20.92	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	SPP2	Q13103	211 aa		20.92	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		20.92	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	HAUS7	Q99871	368 aa		20.92	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	20.92	■□□□□ 0.94	1e-6	■■■□□ 17.9
HDAC10-216	ENST00000489424	PALD1	Q9ULE6	856 aa		20.92	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	HTT	P42858	3142 aa		20.92	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		20.91	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	PDE6A	P16499	860 aa		20.91	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	20.91	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	CAP1	Q01518	475 aa		20.91	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		20.91	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	20.91	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAJC18	Q9H819	358 aa		20.91	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		20.91	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	20.91	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	SRRD	Q9UH36	339 aa		20.91	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	CPA4	Q9UI42	421 aa		20.91	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		20.91	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		20.9	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM196B	A6NMK8	535 aa		20.9	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	APBB1	O00213	710 aa		20.9	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	GOLIM4	O00461	696 aa		20.9	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	CAPN2	P17655	700 aa		20.9	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	20.9	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	PSMC4	P43686	418 aa		20.9	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	BACE1	P56817	501 aa		20.9	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	20.9	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		20.9	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		20.9	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF333	Q96JL9	665 aa		20.9	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	DOCK1	Q14185	1865 aa		20.9	■□□□□ 0.94
HDAC10-216	ENST00000489424	SLURP2	P0DP57	97 aa		20.89	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	UBE3C	Q15386	1083 aa		20.89	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		20.89	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		20.89	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	20.89	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	20.88	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	USP17L10	C9JJH3	530 aa		20.88	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP2C8	P10632	490 aa		20.88	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	OSBP	P22059	807 aa		20.88	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	FCGRT	P55899	365 aa		20.88	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		20.88	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		20.88	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	20.88	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM47	Q96LD4	638 aa		20.88	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	20.88	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		20.88	■□□□□ 0.93
HDAC10-216	ENST00000489424	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	20.88	■□□□□ 0.93

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