RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481518.1

PSME4-208, Transcript of proteasome activator subunit 4, human

TSL 5

Gene PSME4, Length 886 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME4-208	ENST00000481518	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	28.03	■■■□□ 2.08
PSME4-208	ENST00000481518	PDHX	O00330	501 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PSME4-208	ENST00000481518	TLR2	O60603	784 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PSME4-208	ENST00000481518	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PSME4-208	ENST00000481518	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
PSME4-208	ENST00000481518	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
PSME4-208	ENST00000481518	PALD1	Q9ULE6	856 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PSME4-208	ENST00000481518	PTPRF	P10586	1907 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	GOLIM4	O00461	696 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	RGS19	P49795	217 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	DNAJC18	Q9H819	358 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		28	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	SOX10	P56693	466 aa		28	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	PDE6A	P16499	860 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	CAP2	P40123	477 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	EFCC1	Q9HA90	598 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	TRIM75P	A6NK02	468 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	ATP5J	P18859	108 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	CPA4	Q9UI42	421 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	JAG1	P78504	1218 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	C17orf99	Q6UX52	265 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	CERS3	Q8IU89	383 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	DCTPP1	Q9H773	170 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		27.95	■■■□□ 2.07
PSME4-208	ENST00000481518	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PSME4-208	ENST00000481518	USP5	P45974	858 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PSME4-208	ENST00000481518	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
PSME4-208	ENST00000481518	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PSME4-208	ENST00000481518	MYH1	P12882	1939 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PSME4-208	ENST00000481518	CYP2C8	P10632	490 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PSME4-208	ENST00000481518	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
PSME4-208	ENST00000481518	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
PSME4-208	ENST00000481518	HAUS7	Q99871	368 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PSME4-208	ENST00000481518	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PSME4-208	ENST00000481518	SPP2	Q13103	211 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PSME4-208	ENST00000481518	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PSME4-208	ENST00000481518	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
PSME4-208	ENST00000481518	HTT	P42858	3142 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PSME4-208	ENST00000481518	HLA-DOA	P06340	250 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PSME4-208	ENST00000481518	CTGF	P29279	349 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PSME4-208	ENST00000481518	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PSME4-208	ENST00000481518	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
PSME4-208	ENST00000481518	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PSME4-208	ENST00000481518	USP17L5	A8MUK1	530 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PSME4-208	ENST00000481518	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
PSME4-208	ENST00000481518	CHGB	P05060	677 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PSME4-208	ENST00000481518	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
PSME4-208	ENST00000481518	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PSME4-208	ENST00000481518	GDF11	O95390	407 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PSME4-208	ENST00000481518	TREML2	Q5T2D2	321 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PSME4-208	ENST00000481518	LCORL	Q8N3X6	602 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PSME4-208	ENST00000481518	CRBN	Q96SW2	442 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PSME4-208	ENST00000481518	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PSME4-208	ENST00000481518	BCR	P11274	1271 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PSME4-208	ENST00000481518	ADD2	P35612	726 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PSME4-208	ENST00000481518	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PSME4-208	ENST00000481518	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PSME4-208	ENST00000481518	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PSME4-208	ENST00000481518	EHD4	Q9H223	541 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PSME4-208	ENST00000481518	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PSME4-208	ENST00000481518	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PSME4-208	ENST00000481518	ASNS	P08243	561 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PSME4-208	ENST00000481518	PLCD1	P51178	756 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PSME4-208	ENST00000481518	HMGCS2	P54868	508 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PSME4-208	ENST00000481518	EVX2	Q03828	476 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PSME4-208	ENST00000481518	KIF22	Q14807	665 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PSME4-208	ENST00000481518	ARHGEF6	Q15052	776 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PSME4-208	ENST00000481518	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PSME4-208	ENST00000481518	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
PSME4-208	ENST00000481518	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PSME4-208	ENST00000481518	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PSME4-208	ENST00000481518	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PSME4-208	ENST00000481518	ARMC5	Q96C12	935 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PSME4-208	ENST00000481518	TRIM47	Q96LD4	638 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PSME4-208	ENST00000481518	WDR18	Q9BV38	432 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PSME4-208	ENST00000481518	ARMT1	Q9H993	441 aa		27.86	■■■□□ 2.05

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.2 ms