RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472218.1

RPS18-231, Transcript of ribosomal protein S18, human

TSL 2

Gene RPS18, Length 1,109 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS18-231	ENST00000472218	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		12.7	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	KIF3A	Q9Y496	699 aa		12.7	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		12.7	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	PSME4	Q14997	1843 aa		12.69	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	SCN9A	Q15858	1988 aa		12.69	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	MYO1B	O43795	1136 aa		12.69	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	PDC	P20941	246 aa		12.69	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	ANKS1A	Q92625	1134 aa		12.69	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	NID2	Q14112	1375 aa		12.69	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	COL4A5	P29400	1685 aa		12.68	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	12.68	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	GABPA	Q06546	454 aa		12.68	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		12.68	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		12.68	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		12.68	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	FAM83A	Q86UY5	434 aa		12.68	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	DGKH	Q86XP1	1220 aa		12.68	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		12.68	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	LY9	Q9HBG7	655 aa		12.68	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		12.68	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	TOMM22	Q9NS69	142 aa		12.68	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		12.68	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		12.68	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		12.68	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	CDKL5	O76039	1030 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	CALM1	P0DP23	149 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	CALM2	P0DP24	149 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	CALM3	P0DP25	149 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	WTAP	Q15007	396 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	CCDC17	Q96LX7	622 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	CCDC69	A6NI79	296 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	GRIN3B	O60391	1043 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	CYP2D6	P10635	497 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	CDK8	P49336	464 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	PLCD1	P51178	756 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	RASSF7	Q02833	373 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	APOBR	Q0VD83	1088 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	SEC23A	Q15436	765 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	GPC2	Q8N158	579 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	MAP3K14	Q99558	947 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	TSPY2	A6NKD2	308 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	ZBTB43	O43298	467 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	DDAH1	O94760	285 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	LARGE1	O95461	756 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	NOV	P48745	357 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	TNFAIP1	Q13829	316 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	APOA5	Q6Q788	366 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	CHST3	Q7LGC8	479 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	FAM151A	Q8WW52	585 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	12.65	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	12.65	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	12.65	□□□□□ -0.38
RPS18-231	ENST00000472218	TNKS	O95271	1327 aa		12.64	□□□□□ -0.39
RPS18-231	ENST00000472218	UTRN	P46939	3433 aa		12.64	□□□□□ -0.39
RPS18-231	ENST00000472218	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		12.64	□□□□□ -0.39
RPS18-231	ENST00000472218		H7C1D1	291 aa		12.64	□□□□□ -0.39
RPS18-231	ENST00000472218	RASA1	P20936	1047 aa		12.64	□□□□□ -0.39
RPS18-231	ENST00000472218	TNNI2	P48788	182 aa		12.64	□□□□□ -0.39
RPS18-231	ENST00000472218	PRELP	P51888	382 aa		12.64	□□□□□ -0.39
RPS18-231	ENST00000472218	ST3GAL1	Q11201	340 aa		12.64	□□□□□ -0.39
RPS18-231	ENST00000472218	SCRN1	Q12765	414 aa		12.64	□□□□□ -0.39
RPS18-231	ENST00000472218	NFIA	Q12857	509 aa		12.64	□□□□□ -0.39
RPS18-231	ENST00000472218	PICALM	Q13492	652 aa		12.64	□□□□□ -0.39
RPS18-231	ENST00000472218	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	12.64	□□□□□ -0.39
RPS18-231	ENST00000472218	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		12.64	□□□□□ -0.39

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