RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BCRP11274 1271 aa32.06■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZAP70P43403 619 aa32.06■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP32.06■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP32.06■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SRRDQ9UH36 339 aa32.06■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa32.06■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTPRFP10586 1907 aa32.05■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGSF3O75054 1194 aa32.05■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP4CP60510 307 aa32.05■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa32.05■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP32.05■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYCP01106 439 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OSBPP22059 807 aa32.04■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADGRA1Q86SQ6 560 aa32.03■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PI4KBQ9UBF8 816 aa32.03■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MS4A1P11836 297 aa32.02■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAP2P40123 477 aa32.02■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERC1Q8IUD2 1116 aa32.02■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa32.02■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BRCA2P51587 3418 aa32.02■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYPNQ86TC9 1320 aa32.01■■■□□ 2.72
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FCGRTP55899 365 aa32.01■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa32.01■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAET1EQ8TD07 263 aa32.01■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa32.01■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa32.01■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP32.01■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP32■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPP2Q13103 211 aa32■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP32■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBC1D2Q9BYX2 928 aa32■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATAD5Q96QE3 1844 aa31.99■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF280CQ8ND82 737 aa31.99■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FLT1P17948 1338 aa31.99■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYP7A1P22680 504 aa31.98■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP17L5A8MUK1 530 aa31.97■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IDH1O75874 414 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRK4P32298 578 aa31.97■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TREML2Q5T2D2 321 aa31.97■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AACSQ86V21 672 aa31.97■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PNMA3Q9UL41 463 aa31.97■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa31.97■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SIPA1L1O43166 1804 aa31.96■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MGAMO43451 1857 aa31.96■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRKCZQ05513 592 aa31.96■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa31.96■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOCADQ5VW36 1801 aa31.96■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP31.95■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM34Q9BYJ4 488 aa31.95■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AS3MTQ9HBK9 375 aa31.95■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PALD1Q9ULE6 856 aa31.95■■■□□ 2.71
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HMGCS2P54868 508 aa31.94■■■□□ 2.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa31.94■■■□□ 2.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTFR1Q15390 333 aa31.93■■■□□ 2.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LOC285556D6RIA3 1793 aa31.93■■■□□ 2.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASNSP08243 561 aa31.92■■■□□ 2.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP31.92■■■□□ 2.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CERS3Q8IU89 383 aa31.92■■■□□ 2.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAGEB6Q8N7X4 407 aa31.92■■■□□ 2.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAJC18Q9H819 358 aa31.92■■■□□ 2.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa31.92■■■□□ 2.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP31.92■■■□□ 2.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GABRQQ9UN88 632 aa31.92■■■□□ 2.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HLA-DOAP06340 250 aa31.91■■■□□ 2.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAP3K12Q12852 859 aa31.91■■■□□ 2.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SH3D19Q5HYK7 790 aa31.91■■■□□ 2.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa31.91■■■□□ 2.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MIGA1Q8NAN2 632 aa31.91■■■□□ 2.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RHPN1Q8TCX5 695 aa31.91■■■□□ 2.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR18Q9BV38 432 aa31.91■■■□□ 2.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANTXR1Q9H6X2 564 aa31.91■■■□□ 2.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DDX19BQ9UMR2 479 aa31.91■■■□□ 2.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP31.9■■■□□ 2.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLAIN1Q8ND83 568 aa31.9■■■□□ 2.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COG6Q9Y2V7 657 aa31.9■■■□□ 2.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBXN2AP68543 259 aa31.89■■■□□ 2.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP31.89■■■□□ 2.7
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HMMRO75330 724 aa31.88■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP5P45974 858 aa31.88■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP31.88■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FLT3LGP49771 235 aa31.88■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 JAG1P78504 1218 aa31.88■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM110CQ1W6H9 321 aa31.88■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GINM1Q9NU53 330 aa31.88■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 APBB1O00213 710 aa31.87■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCL5P13501 91 aa31.87■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTMR2Q13614 643 aa31.87■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP31.87■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GCC1Q96CN9 775 aa31.87■■■□□ 2.69
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIF1BPQ96EK5 621 aa31.87■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms