RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.64■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 SLC1A4P43007 532 aa23.64■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 MSL1Q68DK7 614 aa23.64■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 CUTAO60888 179 aa23.64■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 PPARAQ07869 468 aa23.64■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 NEO1Q92859 1461 aa23.63■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 TFAP4Q01664 338 aa23.63■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 CNGA4Q8IV77 575 aa23.63■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 CNNM4Q6P4Q7 775 aa23.63■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 IGSF22Q8N9C0 903 aa23.63■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 IFT81Q8WYA0 676 aa23.63■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 DSCC1Q9BVC3 393 aa23.63■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 VPS54Q9P1Q0 977 aa23.62■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 PTH1RQ03431 593 aa23.62■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 TBC1D7Q9P0N9 293 aa23.62■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa23.62■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 BIRC3Q13489 604 aa23.62■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC122Q5T0U0 273 aa23.62■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 GAS2L3Q86XJ1 694 aa23.62■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 ERO1AQ96HE7 468 aa23.62■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.62■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 A0A0D9SFI3 127 aa23.62■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa23.62■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 GYG1P46976 350 aa23.62■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa23.62■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 LRRC24Q50LG9 513 aa23.62■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 MAP3K9P80192 1104 aa23.61■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 GIMAP7Q8NHV1 300 aa23.61■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 GPT2Q8TD30 523 aa23.61■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF202O95125 648 aa23.61■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 ME3Q16798 604 aa23.61■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 HAUS3Q68CZ6 603 aa23.61■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 DYMQ7RTS9 669 aa23.61■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 ERVK-7P63135 1459 aa23.61■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 GRIPAP1Q4V328 841 aa23.61■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 METP08581 1390 aa23.61■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 SMIM23A6NLE4 172 aa23.61■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 ERCC3P19447 782 aa23.61■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 CPXCR1Q8N123 301 aa23.61■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.61■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 GTF2IP78347 998 aa23.6■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 BEND3Q5T5X7 828 aa23.6■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 BCAMP50895 628 aa23.6■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 SNX29Q8TEQ0 813 aa23.6■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 DDX12PQ92771 950 aa23.6■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 FNBP1Q96RU3 617 aa23.6■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.6■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 RPS8P62241 208 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 PALD1Q9ULE6 856 aa23.6■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 GPIHBP1Q8IV16 184 aa23.6■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa23.6■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa23.6■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa23.59■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 OTUD6BQ8N6M0 293 aa23.59■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 CEP83Q9Y592 693 aa23.59■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 SSH3Q8TE77 659 aa23.59■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 USP40Q9NVE5 1235 aa23.59■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 LRWD1Q9UFC0 647 aa23.59■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 SSH2Q76I76 1423 aa23.59■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 TSGA10Q9BZW7 698 aa23.59■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 PAK1Q13153 545 aa23.59■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 BLZF1Q9H2G9 400 aa23.59■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 CALUO43852 315 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 FANCCQ00597 558 aa23.58■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 CALCRLQ16602 461 aa23.58■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 IVLP07476 585 aa23.58■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 KRT25Q7Z3Z0 450 aa23.58■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 CERS3Q8IU89 383 aa23.58■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 STAMQ92783 540 aa23.58■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 SMTNP53814 917 aa23.58■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 WDR44Q5JSH3 913 aa23.58■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 SDR42E1Q8WUS8 393 aa23.58■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 SELENOSQ9BQE4 189 aa23.58■■□□□ 1.37
SMURF1-201ENST00000361125 MBD5Q9P267 1494 aa23.58■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC114Q96M63 670 aa23.58■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.57■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 NLRP12P59046 1061 aa23.57■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 ARHGEF35A5YM69 484 aa23.57■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.57■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 GTF3C6Q969F1 213 aa23.57■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 RSPH14Q9UHP6 348 aa23.57■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 CFBP00751 764 aa23.57■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC25Q86WR0 208 aa23.57■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 MYOM2P54296 1465 aa23.57■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.57■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 ALDH1B1P30837 517 aa23.56■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 PPP1R7Q15435 360 aa23.56■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 MFSD14BQ5SR56 506 aa23.56■■□□□ 1.36
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