RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 MICALCLQ6ZW33 695 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 IFT74Q96LB3 600 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 CLSTN2Q9H4D0 955 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 PDE8BO95263 885 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 USPL1Q5W0Q7 1092 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 SNX29Q8TEQ0 813 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 GPR108Q9NPR9 543 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 CETN3O15182 167 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 HSF2BPO75031 334 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 EEF2P13639 858 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 MAP3K9P80192 1104 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM173BQ6P4H8 233 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 IFNL3Q8IZI9 196 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 CPXCR1Q8N123 301 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 CHURC1Q8WUH1 139 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 TSNARE1Q96NA8 513 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 ARFGAP3Q9NP61 516 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 EXOC7Q9UPT5 735 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 SYNMO15061 1565 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 CHRNDQ07001 517 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM14Q14142 442 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 VWA3BQ502W6 1294 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 CIAO1O76071 339 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A0D9SFI3 127 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRC24Q50LG9 513 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 NSMFQ6X4W1 530 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 BCAMP50895 628 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 BIRC3Q13489 604 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 GTF3C6Q969F1 213 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC77Q9BR77 488 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 PRR36Q9H6K5 1346 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 PREX2Q70Z35 1606 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP2A1O14983 1001 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 RAPGEF1Q13905 1077 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC169A6NNP5 214 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM47AQ5JRC9 791 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 WDR44Q5JSH3 913 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 C2CD5Q86YS7 1000 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF408Q9H9D4 720 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 GUCA1BQ9UMX6 200 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 NOP56O00567 594 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 UBE3CQ15386 1083 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 GREM2Q9H772 168 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 CTNND2Q9UQB3 1225 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 MCTP2Q6DN12 878 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 NCAPH2Q6IBW4 605 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM196AQ6ZSG2 479 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 DNM3Q9UQ16 869 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 SLU7O95391 586 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 STAMBPO95630 424 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 CALCRLQ16602 461 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 JAK2O60674 1132 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 CFBP00751 764 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 PCP11498 1178 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 KDM5CP41229 1560 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 SEMA3EO15041 775 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF202O95125 648 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 CALUO43852 315 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 CBX1P83916 185 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 DPH6Q7L8W6 267 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNJ14Q9UNX9 436 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 TMC4Q7Z404 712 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 CA8P35219 290 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 PAK1Q13153 545 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 PROSER3Q2NL68 480 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 MSL1Q68DK7 614 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF804BA4D1E1 1349 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 PLCB3Q01970 1234 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 TSGA10Q9BZW7 698 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM107BQ9H098 131 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 VPS54Q9P1Q0 977 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 CLCN1P35523 988 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 GJC1P36383 396 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 STRN3Q13033 797 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 USH1GQ495M9 461 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 CDC37L1Q7L3B6 337 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 LZTFL1Q9NQ48 299 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 INCENPQ9NQS7 918 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-201ENST00000344528 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108.6 ms