RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264938.7

SLC9A3-201, Transcript of solute carrier family 9 member A3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC9A3, Length 2,584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3-201ENST00000264938 RASGRP2Q7LDG7 609 aa26.46■■□□□ 1.83
SLC9A3-201ENST00000264938 MICU3Q86XE3 530 aa26.46■■□□□ 1.83
SLC9A3-201ENST00000264938 ACRBPQ8NEB7 543 aa26.46■■□□□ 1.83
SLC9A3-201ENST00000264938 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
SLC9A3-201ENST00000264938 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
SLC9A3-201ENST00000264938 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.46■■□□□ 1.83
SLC9A3-201ENST00000264938 FAM71BQ8TC56 605 aa26.46■■□□□ 1.83
SLC9A3-201ENST00000264938 FAM204AQ9H8W3 233 aa26.46■■□□□ 1.83
SLC9A3-201ENST00000264938 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
SLC9A3-201ENST00000264938 SCARF1Q14162 830 aa26.45■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 CTR9Q6PD62 1173 aa26.45■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 ADORA1P30542 326 aa26.45■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 MYL10Q9BUA6 226 aa26.45■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 HSP90B2PQ58FF3 399 aa26.44■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 PPFIBP1Q86W92 1011 aa26.44■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 EYA2O00167 538 aa26.44■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 GCP02774 474 aa26.44■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 NTRK3Q16288 839 aa26.44■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 APOA5Q6Q788 366 aa26.44■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 CTAGE15A4D2H0 777 aa26.43■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 H7C1W4 665 aa26.43■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 CTAGE8P0CG41 777 aa26.43■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 CASP14P31944 242 aa26.43■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 STX17P56962 302 aa26.43■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 CORO7P57737 925 aa26.43■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 PI16Q6UXB8 463 aa26.43■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 USP49Q70CQ1 688 aa26.43■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 CTAGE6Q86UF2 777 aa26.43■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 CTAGE4Q8IX94 777 aa26.43■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 DACH1Q9UI36 760 aa26.43■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 JRKLQ9Y4A0 524 aa26.43■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 UBN2Q6ZU65 1347 aa26.43■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.43■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 PLCD1P51178 756 aa26.43■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 TBC1D10CQ8IV04 446 aa26.43■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 ECM29Q5VYK3 1845 aa26.42■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 BTBD18B2RXH4 712 aa26.42■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 GPAA1O43292 621 aa26.42■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 PBX1P40424 430 aa26.42■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 TRDNQ13061 729 aa26.42■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 MYH8P13535 1937 aa26.42■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 MFAP3LO75121 409 aa26.42■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 NCAPH2Q6IBW4 605 aa26.42■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 KLHL10Q6JEL2 608 aa26.42■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 CDKL5O76039 1030 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 IARSP41252 1262 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP26.41■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 CD44P16070 742 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 TRIM29Q14134 588 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 WDR19Q8NEZ3 1342 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 PTPREP23469 700 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 ZAP70P43403 619 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 SKIDA1Q1XH10 827 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 APPBP2Q92624 585 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 RNF40O75150 1001 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 SYF2O95926 243 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 GYPCP04921 128 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 TUBB2AQ13885 445 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 NOSTRINQ8IVI9 506 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 TUBB2BQ9BVA1 445 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC9A3-201ENST00000264938 B4E1Z4 1266 aa26.39■■□□□ 1.81
SLC9A3-201ENST00000264938 CASP1P29466 404 aa26.39■■□□□ 1.81
SLC9A3-201ENST00000264938 GUCY1A2P33402 732 aa26.39■■□□□ 1.81
SLC9A3-201ENST00000264938 ARHGAP25P42331 645 aa26.39■■□□□ 1.81
SLC9A3-201ENST00000264938 ERVK-24P63145 666 aa26.39■■□□□ 1.81
SLC9A3-201ENST00000264938 SLC26A6Q9BXS9 759 aa26.39■■□□□ 1.81
SLC9A3-201ENST00000264938 GBP3Q9H0R5 595 aa26.39■■□□□ 1.81
SLC9A3-201ENST00000264938 INCENPQ9NQS7 918 aa26.39■■□□□ 1.81
SLC9A3-201ENST00000264938 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.81
SLC9A3-201ENST00000264938 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa26.38■■□□□ 1.81
SLC9A3-201ENST00000264938 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP26.38■■□□□ 1.81
SLC9A3-201ENST00000264938 KCNJ14Q9UNX9 436 aa26.38■■□□□ 1.81
SLC9A3-201ENST00000264938 SPEF2Q9C093 1822 aa26.38■■□□□ 1.81
SLC9A3-201ENST00000264938 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
SLC9A3-201ENST00000264938 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
SLC9A3-201ENST00000264938 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
SLC9A3-201ENST00000264938 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
SLC9A3-201ENST00000264938 TRIML1Q8N9V2 468 aa26.38■■□□□ 1.81
SLC9A3-201ENST00000264938 SPATA20Q8TB22 786 aa26.38■■□□□ 1.81
SLC9A3-201ENST00000264938 XAGE2Q96GT9 111 aa26.38■■□□□ 1.81
SLC9A3-201ENST00000264938 MED4Q9NPJ6 270 aa26.38■■□□□ 1.81
SLC9A3-201ENST00000264938 ZBTB43O43298 467 aa26.37■■□□□ 1.81
SLC9A3-201ENST00000264938 PIP4K2BP78356 416 aa26.37■■□□□ 1.81
SLC9A3-201ENST00000264938 ESCO1Q5FWF5 840 aa26.37■■□□□ 1.81
SLC9A3-201ENST00000264938 YY1AP1Q9H869 796 aa26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.9 ms